RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 NEK1Q96PY6 1258 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 POTEFA5A3E0 1075 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 ICAM1P05362 532 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 RGS19P49795 217 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
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PTPRK-222ENST00000532751 ACAD9Q9H845 621 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRK-222ENST00000532751 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
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PTPRK-222ENST00000532751 ALAS1P13196 640 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.63■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 RNF146Q9NTX7 359 aa25.63■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 RASEFQ8IZ41 740 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.62■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 CCDC69A6NI79 296 aa25.6■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.6■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 CPVLQ9H3G5 476 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.6■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.59■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRK-222ENST00000532751 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.58■■□□□ 1.69
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PTPRK-222ENST00000532751 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
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PTPRK-222ENST00000532751 CALM2P0DP24 149 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTPRK-222ENST00000532751 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
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PTPRK-222ENST00000532751 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 TINF2Q9BSI4 451 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 USP26Q9BXU7 913 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 POTEB2H3BUK9 544 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRK-222ENST00000532751 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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