RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 DCAF4Q8WV16 495 aa28.25■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC16A2P36021 539 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC41Q15345 812 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC174Q6PII3 467 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD35Q8N283 1001 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ARRDC4Q8NCT1 418 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 GDF15Q99988 308 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO40Q9UH90 709 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF213O14771 459 aa28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF146Q9NTX7 359 aa28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 CNTN2Q02246 1040 aa28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 ACAD9Q9H845 621 aa28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 PGK1P00558 417 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 PDHBP11177 359 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 MUM1L1Q5H9M0 696 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 BTNL9Q6UXG8 535 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 CNPY2Q9Y2B0 182 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-204ENST00000528201 KBTBD13C9JR72 458 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 RARBP10826 455 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ALAS1P13196 640 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM133AQ8N9E0 248 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCYAP1R1P41586 468 aa28.19■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SYDE2Q5VT97 1194 aa28.19■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ESR2Q92731 530 aa28.19■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC14Q96N46 770 aa28.19■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ASTN1O14525 1302 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SOWAHBA6NEL2 793 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 B4E1Z4 1266 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCY6O43306 1168 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 KDM4AO75164 1064 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SNHG28P0DPA3 235 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 AKR1A1P14550 325 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 RTP1P59025 263 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 TKFCQ3LXA3 575 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 FERMT2Q96AC1 680 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAMTS4O75173 837 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ICAM1P05362 532 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF543Q08ER8 600 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ARMCX2Q7L311 632 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 KATNBL1Q9H079 304 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CCPG1Q9ULG6 757 aa28.17■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 POTEB2H3BUK9 544 aa28.16■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 BMP8BP34820 402 aa28.16■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ACVR2BQ13705 512 aa28.16■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.16■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 PHF24Q9UPV7 400 aa28.16■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SMCHD1A6NHR9 2005 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CHMLP26374 656 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SNX17Q15036 470 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP39A1Q9NYL5 469 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PPC1 479 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 MYADML2A6NDP7 307 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM60Q495X7 471 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 DGKHQ86XP1 1220 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF180Q86T96 592 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKS1AQ92625 1134 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 CPVLQ9H3G5 476 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 LAMA4Q16363 1823 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 NFIBO00712 420 aa28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 PTH1RQ03431 593 aa28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC144BQ3MJ40 725 aa28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 NSMFQ6X4W1 530 aa28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 RAD50Q92878 1312 aa28.12■■■□□ 2.09
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