RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 DDX11Q96FC9 970 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 RNF208Q9H0X6 261 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 LY9Q9HBG7 655 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 HTTP42858 3142 aa20.89■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 PLXNB2O15031 1838 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF536O15090 1300 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CCL5P13501 91 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 MTFR1Q15390 333 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ACAD9Q9H845 621 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 SENP2Q9HC62 589 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 RNF146Q9NTX7 359 aa20.88■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 KLRF2D3W0D1 207 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 COBLO75128 1261 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 LIFRP42702 1097 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 GRM4Q14833 912 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CCL14Q16627 93 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 USP26Q9BXU7 913 aa20.87■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 DDAH1O94760 285 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 PGK2P07205 417 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 PSMA5P28066 241 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 TROAPQ12815 778 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CPVLQ9H3G5 476 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.86■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 RPTORQ8N122 1335 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CALM1P0DP23 149 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CALM2P0DP24 149 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CALM3P0DP25 149 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 KIF5BP33176 963 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 FGD1P98174 961 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM32Q13049 653 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K14Q99558 947 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.85■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.84■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 MAML3Q96JK9 1138 aa20.84■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.84■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 PFASO15067 1338 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 POTEFA5A3E0 1075 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 GJB1P08034 283 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.83■□□□□ 0.93
FAAP20-215ENST00000514625 CYP2C19P33261 490 aa20.82■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 GNAQP50148 359 aa20.82■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 NSMFQ6X4W1 530 aa20.82■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.82■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.82■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 MYL10Q9BUA6 226 aa20.82■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 POTEB2H3BUK9 544 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 CAPN2P17655 700 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 USH1GQ495M9 461 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 FBXO11Q86XK2 927 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 DEFB118Q96PH6 123 aa20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 GJA8P48165 433 aa20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 RGS19P49795 217 aa20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 TRAF1Q13077 416 aa20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
FAAP20-215ENST00000514625 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms