RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-225ENST00000513069 WDR19Q8NEZ3 1342 aa17.72■□□□□ 0.43
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SH3BP2-225ENST00000513069 CYTH3O43739 400 aa17.72■□□□□ 0.43
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SH3BP2-225ENST00000513069 KRT32Q14532 448 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-225ENST00000513069 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-225ENST00000513069 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-225ENST00000513069 CATIPQ7Z7H3 387 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-225ENST00000513069 TMTC2Q8N394 836 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-225ENST00000513069 TINF2Q9BSI4 451 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP2-225ENST00000513069 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.72■□□□□ 0.43
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SH3BP2-225ENST00000513069 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
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