RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.36□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.36□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.36□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.36□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 TRAK2O60296 914 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 HMGCRP04035 888 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 APPP05067 770 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 NEK4P51957 841 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 ICA1Q05084 483 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 TATDN2Q93075 761 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 C12orf42Q96LP6 360 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 SWAP70Q9UH65 585 aa7.35□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 GPAA1O43292 621 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 PRDM1O75626 825 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 MAPK4P31152 587 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 CUL4AQ13619 759 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 PLS1Q14651 629 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 MORN1Q5T089 497 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 FSD1Q9BTV5 496 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 FLRT1Q9NZU1 646 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 MYH6P13533 1939 aa7.34□□□□□ -1.23
MITF-215ENST00000478490 FLOT1O75955 427 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TDO2P48775 406 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 APPBP2Q92624 585 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 USP6NLQ92738 828 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ATG4CQ96DT6 458 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.34□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RPTORQ8N122 1335 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RASA1P20936 1047 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RGS2P41220 211 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 COG2Q14746 738 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RNF20Q5VTR2 975 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LRCH3Q96II8 777 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TMX3Q96JJ7 454 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 VCPKMTQ9H867 229 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 INCENPQ9NQS7 918 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TMX2Q9Y320 296 aa7.33□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ERCC3P19447 782 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PSMA5P28066 241 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CNGA1P29973 690 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CYP2C19P33261 490 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CCNA1P78396 465 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MAP2K5Q13163 448 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ANO1Q5XXA6 986 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 KCNB2Q92953 911 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CCDC17Q96LX7 622 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 APBA2Q99767 749 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms