RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 RASSF10A6NK89 507 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 ADAM23O75077 832 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 ARNTP27540 789 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 ANAPC15P60006 121 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 KRT76Q01546 638 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 CHSY3Q70JA7 882 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 PODNQ7Z5L7 613 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 MCF2L2Q86YR7 1114 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.09□□□□□ -1.59
CYCSP43-201ENST00000438233 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.09□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 COL6A3P12111 3177 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 M0R082 166 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 MAFGO15525 162 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 OIP5O43482 229 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 PTMSP20962 102 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 APOBRQ0VD83 1088 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 NFIXQ14938 502 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 LRRC3Q9BY71 257 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 CBX8Q9HC52 389 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 UBP1Q9NZI7 540 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.08□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 NUP98P52948 1817 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 MARCH6O60337 910 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 F13A1P00488 732 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 CYP11A1P05108 521 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SLURP2P0DP57 97 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 BCRP11274 1271 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SOX9P48436 509 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 GSTM4Q03013 218 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 MPP2Q14168 576 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SOGA3Q5TF21 947 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC51AQ86UW1 340 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 STK35Q8TDR2 534 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 NKD1Q969G9 470 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 GINM1Q9NU53 330 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 COL4A1P02462 1669 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 PSME4Q14997 1843 aa5.07□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM221AA4D161 298 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 ANKRD62A6NC57 917 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 LINC01387J3KSC0 135 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 FSCN2O14926 492 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 BPNT1O95861 308 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 AMPD1P23109 780 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 CDC25BP30305 580 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 RFC4P35249 363 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 RBL2Q08999 1139 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 SEPT6Q14141 434 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 RASIP1Q5U651 963 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 PDZD3Q86UT5 571 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 LDHDQ86WU2 507 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 BTBD6Q96KE9 485 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 CORO1BQ9BR76 489 aa5.06□□□□□ -1.6
CYCSP43-201ENST00000438233 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms