RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CHST3Q7LGC8 479 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 MAML3Q96JK9 1138 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CAPN2P17655 700 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TKFCQ3LXA3 575 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 BRCA2P51587 3418 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ERICH2A1L162 156 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ALAS1P13196 640 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP14Q460N5 1801 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ICAM1P05362 532 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ACAD9Q9H845 621 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF146Q9NTX7 359 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMA4Q16363 1823 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ANTXR2P58335 489 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 WTAPQ15007 396 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF20Q5VTR2 975 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 CPVLQ9H3G5 476 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 CNGA1P29973 690 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPV1Q8NER1 839 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 SENP2Q9HC62 589 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 LHX8Q68G74 356 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 TINF2Q9BSI4 451 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 PRC1O43663 620 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 CYBAP13498 195 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 MCM5P33992 734 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA2Q9UL42 364 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 MTA3Q9BTC8 594 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEB2H3BUK9 544 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTN2Q02246 1040 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRF2D3W0D1 207 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 RASEFQ8IZ41 740 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TMTC2Q8N394 836 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM87BQ96K49 555 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NEK1Q96PY6 1258 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 LY9Q9HBG7 655 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MSCO60682 206 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 TROAPQ12815 778 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NSMFQ6X4W1 530 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 PFASO15067 1338 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SEPT4O43236 478 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 GRM4Q14833 912 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 FGD4Q96M96 766 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 REC8O95072 547 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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