RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
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PTPRN-202ENST00000409251 CNGA4Q8IV77 575 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRN-202ENST00000409251 KCNJ6P48051 423 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRN-202ENST00000409251 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRN-202ENST00000409251 OXER1Q8TDS5 423 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRN-202ENST00000409251 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRN-202ENST00000409251 USP17L3A6NCW0 530 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRN-202ENST00000409251 USP17L4A6NCW7 530 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRN-202ENST00000409251 CCDC172P0C7W6 258 aa14.46□□□□□ -0.09
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