RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327157.3

PRM3-201, Transcript of protamine 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PRM3, Length 424 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3-201ENST00000327157 SOX10P56693 466 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 TROAPQ12815 778 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 KRT32Q14532 448 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 KCTD1Q719H9 257 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 DPP9Q86TI2 863 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 SHISA4Q96DD7 197 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 MMP19Q99542 508 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 RNF208Q9H0X6 261 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 ACAD9Q9H845 621 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 RIPK3Q9Y572 518 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.03□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
PRM3-201ENST00000327157 ERICH2A1L162 156 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 RCAN1P53805 252 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 ANTXR2P58335 489 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TRAF1Q13077 416 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PLS1Q14651 629 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 SGMS1Q86VZ5 419 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TEX2Q8IWB9 1127 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 FLRT1Q9NZU1 646 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TAF6LQ9Y6J9 622 aa13.02□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 RAD21O60216 631 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CAPN15O75808 1086 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 DDAH1O94760 285 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 HSPA4P34932 840 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CCL14Q16627 93 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CCDC96Q2M329 555 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 LHX8Q68G74 356 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 MORC4Q8TE76 937 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TINF2Q9BSI4 451 aa13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 SEPT4O43236 478 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CALM1P0DP23 149 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CALM2P0DP24 149 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CALM3P0DP25 149 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 NKX3-2P78367 333 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 GRM4Q14833 912 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 WTAPQ15007 396 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 WDR78Q5VTH9 848 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 SKAP1Q86WV1 359 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 IL17RAQ96F46 866 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 RIOX1Q9H6W3 641 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 LY9Q9HBG7 655 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 RNF146Q9NTX7 359 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 MAD2L2Q9UI95 211 aa13□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 IKQ13123 557 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PPP2R5BQ15173 497 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 RASGRP2Q7LDG7 609 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CPXCR1Q8N123 301 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 FGD4Q96M96 766 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CYP39A1Q9NYL5 469 aa12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 ABCB11O95342 1321 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 PRC1O43663 620 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 COL6A1P12109 1028 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 KIF5BP33176 963 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TRIM32Q13049 653 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 TMEM67Q5HYA8 995 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CATIPQ7Z7H3 387 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 ADGRF4Q8IZF3 695 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 ANKRD35Q8N283 1001 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 DNERQ8NFT8 737 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 DDX11Q96FC9 970 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 DEFB118Q96PH6 123 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 NEK1Q96PY6 1258 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.98□□□□□ -0.33
PRM3-201ENST00000327157 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms