RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 KLRF2D3W0D1 207 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 FZD9O00144 591 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM83AQ86UY5 434 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CSRNP1Q96S65 589 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 GJB4Q9NTQ9 266 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CLRN2A0PK11 232 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SCG2P13521 617 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CALML3P27482 149 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFAIP1Q13829 316 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 STK38Q15208 465 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PKN1Q16512 942 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 JMYQ8N9B5 988 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 MKL1Q969V6 931 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 USP28Q96RU2 1077 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 VEZTQ9HBM0 779 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 NYAP2Q9P242 653 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 MTMR7Q9Y216 660 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD18B2RXH4 712 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C1D1 291 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT10BO00744 389 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 YEATS4O95619 227 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ME1P48163 572 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP5P59047 1200 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP2B2Q01814 1243 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ANO1Q5XXA6 986 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF28PB7ZC32 967 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTLC2O15270 562 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 LMNB1P20700 586 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT2P35908 639 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT17Q6IS24 598 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 BICD2Q8TD16 824 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L5A8MUK1 530 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 PDHBP11177 359 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF445P59923 1031 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 RASSF7Q02833 373 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A14Q15043 492 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ADALQ6DHV7 355 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC148Q8NFR7 591 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC18Q9H819 358 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms