RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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HOXD9-201ENST00000249499 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.89■■□□□ 1.73
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HOXD9-201ENST00000249499 CACNB3P54284 484 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
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HOXD9-201ENST00000249499 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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HOXD9-201ENST00000249499 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.86■■□□□ 1.73
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HOXD9-201ENST00000249499 VSTM4Q8IW00 320 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 MTRQ99707 1265 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
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HOXD9-201ENST00000249499 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
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HOXD9-201ENST00000249499 MED15Q96RN5 788 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 GMLQ99445 158 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 SLC1A4P43007 532 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 KCNB1Q14721 858 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXD9-201ENST00000249499 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.83■■□□□ 1.73
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