RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rexo5D3YW29 759 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stim1P70302 685 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grm4Q68EF4 912 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Strip1Q8C079 837 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exoc1Q8R3S6 894 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r71L7N2D8 855 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mxd3Q80US8 206 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zswim4Q8C7B8 1101 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grem2O88273 168 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nkx2-5P42582 318 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rasa2P58069 847 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnni3kQ5GIG6 834 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rhpn1Q61085 643 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ushbp1Q8R370 680 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm28042B7ZCM9 1014 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxn3Q499D0 457 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim9Q8C7M3 817 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Alpk1Q9CXB8 1231 aa29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh3bp1P55194 680 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AsnsQ61024 561 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Asic1Q6NXK8 526 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apopt1Q9CQW7 192 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem39aQ9CYC3 486 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp597E9Q6S0 419 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pth1rP41593 591 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psd3Q2PFD7 1037 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ItpripQ3TNL8 555 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Taok3Q8BYC6 898 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GlyctkQ8QZY2 523 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsc2Q61037 1814 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 InhbeO08717 350 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mdh1P14152 334 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lilrb3P97484 841 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LarsQ8BMJ2 1178 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep95Q8BVV7 827 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phc3Q8CHP6 981 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AdpgkQ8VDL4 496 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd274Q9EP73 290 aa29.39■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Calcoco2A2A6M5 331 aa29.39■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif6O55135 245 aa29.39■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MtrrQ8C1A3 696 aa29.39■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gna11P21278 359 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zhx1P70121 873 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DaglaQ6WQJ1 1044 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RbsnQ80Y56 783 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NapgQ9CWZ7 312 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bend4P86174 541 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spata4Q8K3V1 295 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akt1s1Q9D1F4 257 aa29.38■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam178bQ24JP3 464 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ParnQ8VDG3 624 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smc1bQ920F6 1248 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RabggtaQ9JHK4 567 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PfasQ5SUR0 1337 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lamb1P02469 1786 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10378F6XQQ1 160 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nol4P60954 483 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc26Q8BS45 554 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa29.37■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl2c3P04768 224 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TbcbQ9D1E6 244 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Emilin2Q8K482 1074 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef6Q8K4I3 771 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ByslO54825 436 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LdhaP06151 332 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psg29Q3URN6 468 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epc1Q8C9X6 813 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rassf4Q8CB96 322 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf131Q8K3J5 619 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc7Q9QYI3 494 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klrc1Q9Z202 244 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Emc10Q3TAS6 258 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmed8Q3UHI4 326 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb39Q6PDK0 712 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Onecut3Q8K557 490 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CutaQ9CQ89 177 aa29.35■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MyrflQ3UN70 904 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Galntl5Q9D4M9 431 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gdf11Q9Z1W4 405 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nup188Q6ZQH8 1759 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hspa1lP16627 641 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EgfrQ01279 1210 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gcnt1Q09324 428 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep112Q5PR68 954 aa29.34■■■□□ 2.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 KhnynQ80U38 671 aa29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.9 ms