Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Phc3Q8CHP6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,06■■■■□ 3,52
Phc3Q8CHP6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Phc3Q8CHP6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Phc3Q8CHP6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Phc3Q8CHP6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Phc3Q8CHP6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Phc3Q8CHP6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Phc3Q8CHP6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Phc3Q8CHP6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Phc3Q8CHP6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Phc3Q8CHP6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,93
Phc3Q8CHP6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Phc3Q8CHP6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Phc3Q8CHP6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Phc3Q8CHP6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Phc3Q8CHP6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Phc3Q8CHP6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Phc3Q8CHP6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Phc3Q8CHP6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Phc3Q8CHP6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Phc3Q8CHP6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Phc3Q8CHP6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Phc3Q8CHP6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Phc3Q8CHP6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,73
Phc3Q8CHP6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Phc3Q8CHP6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Phc3Q8CHP6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Phc3Q8CHP6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Phc3Q8CHP6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Phc3Q8CHP6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Phc3Q8CHP6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Phc3Q8CHP6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Phc3Q8CHP6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Phc3Q8CHP6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Phc3Q8CHP6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Phc3Q8CHP6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Phc3Q8CHP6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Phc3Q8CHP6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Phc3Q8CHP6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Phc3Q8CHP6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Phc3Q8CHP6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Phc3Q8CHP6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Phc3Q8CHP6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Phc3Q8CHP6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Phc3Q8CHP6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Phc3Q8CHP6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Phc3Q8CHP6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Phc3Q8CHP6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Phc3Q8CHP6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Phc3Q8CHP6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Phc3Q8CHP6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Phc3Q8CHP6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Phc3Q8CHP6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Phc3Q8CHP6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Phc3Q8CHP6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Phc3Q8CHP6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Phc3Q8CHP6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Phc3Q8CHP6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Phc3Q8CHP6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Phc3Q8CHP6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Phc3Q8CHP6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Phc3Q8CHP6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Phc3Q8CHP6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Phc3Q8CHP6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Phc3Q8CHP6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Phc3Q8CHP6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Phc3Q8CHP6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Phc3Q8CHP6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Phc3Q8CHP6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Phc3Q8CHP6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Phc3Q8CHP6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Phc3Q8CHP6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Phc3Q8CHP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Phc3Q8CHP6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Phc3Q8CHP6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Phc3Q8CHP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Phc3Q8CHP6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Phc3Q8CHP6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Phc3Q8CHP6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Phc3Q8CHP6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Phc3Q8CHP6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Phc3Q8CHP6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Phc3Q8CHP6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Phc3Q8CHP6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Phc3Q8CHP6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Phc3Q8CHP6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Phc3Q8CHP6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Phc3Q8CHP6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Phc3Q8CHP6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Phc3Q8CHP6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Phc3Q8CHP6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Phc3Q8CHP6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Phc3Q8CHP6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Phc3Q8CHP6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Phc3Q8CHP6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Phc3Q8CHP6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Phc3Q8CHP6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Phc3Q8CHP6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Phc3Q8CHP6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
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