Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Nkx2-5P42582 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Nkx2-5P42582 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nkx2-5P42582 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nkx2-5P42582 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Nkx2-5P42582 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nkx2-5P42582 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nkx2-5P42582 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nkx2-5P42582 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nkx2-5P42582 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Nkx2-5P42582 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nkx2-5P42582 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nkx2-5P42582 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nkx2-5P42582 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nkx2-5P42582 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Nkx2-5P42582 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Nkx2-5P42582 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nkx2-5P42582 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nkx2-5P42582 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nkx2-5P42582 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nkx2-5P42582 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nkx2-5P42582 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Nkx2-5P42582 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nkx2-5P42582 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nkx2-5P42582 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nkx2-5P42582 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nkx2-5P42582 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nkx2-5P42582 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nkx2-5P42582 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Nkx2-5P42582 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nkx2-5P42582 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nkx2-5P42582 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Nkx2-5P42582 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nkx2-5P42582 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nkx2-5P42582 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nkx2-5P42582 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nkx2-5P42582 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nkx2-5P42582 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nkx2-5P42582 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Nkx2-5P42582 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nkx2-5P42582 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nkx2-5P42582 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nkx2-5P42582 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nkx2-5P42582 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Nkx2-5P42582 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Nkx2-5P42582 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nkx2-5P42582 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nkx2-5P42582 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nkx2-5P42582 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nkx2-5P42582 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nkx2-5P42582 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nkx2-5P42582 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nkx2-5P42582 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nkx2-5P42582 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nkx2-5P42582 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nkx2-5P42582 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nkx2-5P42582 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nkx2-5P42582 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nkx2-5P42582 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nkx2-5P42582 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Nkx2-5P42582 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nkx2-5P42582 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nkx2-5P42582 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nkx2-5P42582 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Nkx2-5P42582 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nkx2-5P42582 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nkx2-5P42582 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nkx2-5P42582 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nkx2-5P42582 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nkx2-5P42582 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Nkx2-5P42582 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nkx2-5P42582 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nkx2-5P42582 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nkx2-5P42582 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nkx2-5P42582 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-5P42582 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx2-5P42582 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx2-5P42582 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nkx2-5P42582 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nkx2-5P42582 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nkx2-5P42582 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Nkx2-5P42582 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-5P42582 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx2-5P42582 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx2-5P42582 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nkx2-5P42582 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nkx2-5P42582 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx2-5P42582 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-5P42582 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nkx2-5P42582 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-5P42582 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-5P42582 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx2-5P42582 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nkx2-5P42582 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nkx2-5P42582 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx2-5P42582 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nkx2-5P42582 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nkx2-5P42582 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nkx2-5P42582 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx2-5P42582 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms