RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A ERR3P42222 437 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A STP3Q05937 343 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YDL242WQ07746 117 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YOR387CQ08910 206 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SES1P07284 462 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A KRS1P15180 591 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A MCK1P21965 375 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PCL1P24867 279 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PEP3P27801 918 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SKN1P33336 771 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A LAG1P38703 411 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ARB1P40024 610 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A FET5P43561 622 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RTS3P53289 263 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A HOM3P10869 527 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SAC1P32368 623 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PMU1P36069 295 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SNG1P46950 547 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SMC3P47037 1230 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YRB30P53107 440 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YGR126WP53274 230 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A TGL2P54857 326 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PIR3Q03180 325 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YDL057WQ07379 328 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A AAD4Q07747 329 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A AMD2P22580 549 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A DRE2P36152 348 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PAM1P37304 830 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A FAT1P38225 669 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YGR127WP53275 312 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YPR003CP53394 754 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A VPS74Q06385 345 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A HMS1Q12398 434 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A BNI1P41832 1953 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SAM1P10659 382 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SAM2P19358 384 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A FUN19P28003 413 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YHR020WP38708 688 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RTS1P38903 757 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YND1P40009 630 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A HIT1P46973 164 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A NPA3P47122 385 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ASE1P50275 885 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A POP6P53218 158 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SOL4P53315 255 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A CRD1Q07560 283 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A DIN7Q12086 430 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SKM1Q12469 655 aa0.44□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SNF3P10870 884 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RPL8AP17076 256 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SNC1P31109 117 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ACH1P32316 526 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SLC1P33333 303 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A NPR3P38742 1146 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RSM23Q01163 450 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PRM7Q12459 698 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A TKL1P23254 680 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YJU2P28320 278 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A TIF3P34167 436 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YBL029WP38201 376 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A VID24P38263 362 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A IST3P40565 148 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A COS12P53053 380 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A TRS130Q03660 1102 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A DBP10Q12389 995 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A MSS1P32559 526 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A COX13P32799 129 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RPH1P39956 796 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YFR020WP43600 232 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A IRC15Q02733 499 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A NDE2Q07500 545 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data0.43□□□□□ -2.34not detected
YPL060C-AYPL060C-A YPQ1Q12010 308 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A HUA2Q12134 243 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YLR108CQ12259 485 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data0.43□□□□□ -2.34not detected
YPL060C-AYPL060C-A YBR298C-AQ8TGK4 73 aa0.43□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A TEF1P02994 458 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SEC6P32844 805 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SHP1P34223 423 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A MRPS9P38120 278 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A LAM5P43560 674 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YLR345WQ06137 509 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A CDD1Q06549 142 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A LEU9Q12166 604 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ARP6Q12509 438 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A GID7P25569 745 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ZIP1P31111 875 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ELO1P39540 310 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A CAF40P53829 373 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YMR027WQ04371 470 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ARP9Q05123 467 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A HRI1Q05905 244 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A HFI1Q12060 488 aa0.42□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A CHC1P22137 1653 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
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