RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	TGL1	P34163	548 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MCM7	P38132	845 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ERC1	P38767	581 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RBG1	P39729	369 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	VPS70	P47161	811 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GTR2	P53290	341 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YNL140C	P53910	189 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DID2	P69771	204 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PET117	Q02771	107 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TVP15	Q03860	143 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SPC19	Q03954	165 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HER1	Q12276	1246 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RPN13	O13563	156 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	COX3	P00420	269 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AI4	P03878	556 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CBF1	P17106	351 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	EMC1	P25574	760 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PRR1	P28708	518 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HIR2	P32480	875 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HSL7	P38274	827 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHR219W	P38900	624 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PIK1	P39104	1066 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YAR028W	P39548	234 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	IAH1	P41734	238 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	THI6	P41835	540 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PMT3	P47190	753 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GPI8	P49018	411 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CDC55	Q00362	526 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CDC14	Q00684	551 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GAL80	P04387	435 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DBF2	P22204	572 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MED6	P38782	295 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MIG2	P53035	382 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BNA5	Q05979	453 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	STB3	Q12427	513 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	VPS33	P20795	691 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	EMC3	P36039	253 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHR182W	P38870	785 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YEL076C	P39971	216 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASG7	P46993	209 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	IML2	P47031	731 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ORC4	P54791	529 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	TRM12	Q04235	462 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YLR346C	Q06139	101 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ECM7	Q06200	448 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ATG29	Q12092	213 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ARG3	P05150	338 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CIT2	P08679	460 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MCM1	P11746	286 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	STE6	P12866	1290 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ITR2	P30606	609 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	HPM1	P40481	377 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YML108W	Q03759	105 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	DDC1	Q08949	612 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SNF4	P12904	322 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SEN2	P16658	377 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	BEM1	P29366	551 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHI9	P38765	294 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YHR035W	P38769	630 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	FHL1	P39521	936 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	MTW1	P39731	289 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ARG2	P40360	574 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	YIL166C	P40445	542 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	JAC1	P53193	184 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CLD1	P53264	445 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RCF2	P53721	224 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	SCS7	Q03529	384 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	VPS74	Q06385	345 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GPN3	Q06543	272 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
RRP5	YMR229C	CSM1	P25651	190 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RRP5	YMR229C	RNP1	P32385	249 aa		3.29	□□□□□ -1.88

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