RNA–Protein interactions for RNA: YMR017W

SPO20, Transcript of Meiosis-specific subunit of the t-SNARE complex, yeast

Gene SPO20, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO20	YMR017W	ARP9	Q05123	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO20	YMR017W	ECI1	Q05871	280 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO20	YMR017W	YAP7	Q08182	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO20	YMR017W	DSE3	Q08729	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO20	YMR017W	UBX3	Q12229	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPO20	YMR017W	CBP1	P07252	654 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	POL4	P25615	582 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ELO1	P39540	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	HXT9	P40885	567 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	NGL3	Q03210	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YML037C	Q03703	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	MLH2	Q07980	695 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RPB8	P20436	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PGS1	P25578	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	GAC1	P28006	793 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ATO2	P32907	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ANS1	P38832	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PCL6	P40038	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YIL152W	P40455	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SGM1	P47166	707 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YNL234W	P53857	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	BOP3	P53958	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SPE4	Q12455	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YIH1	P25637	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	TSC10	P38342	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YIL060W	P40519	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SNM1	P40993	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	LCL3	P53153	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YNL181W	P53878	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ESBP6	P53918	673 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SNA4	Q07549	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RTT109	Q07794	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RRI2	Q12348	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	IMP2'	P32351	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ARP1	P38696	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	DBP8	P38719	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	FLC2	P39719	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	AFG3	P39925	761 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	IRC8	P47046	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	DSD1	P53095	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	GRC3	Q07845	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	TEN1	Q07921	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	CIR2	Q08822	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SGF29	P25554	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	EFM6	P53970	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	EKI1	Q03764	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	NMD4	Q12129	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ARG81	P05085	880 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SYN8	P31377	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PDR3	P33200	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	UBA4	P38820	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SPO20	YMR017W	PHO90	P39535	881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	FAR3	P46671	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PKP2	P53170	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	BET4	Q00618	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PUT2	P07275	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	IMG1	P25626	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YPK3	P38070	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	CCT6	P39079	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RTS2	P40962	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	IAH1	P41734	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	PTR3	P43606	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	MRX6	P48564	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	YGR127W	P53275	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RDR1	Q08904	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	RCN2	Q12044	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPO20	YMR017W	SNF3	P10870	884 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPO20	YMR017W	MET8	P15807	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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