RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PRD1	P25375	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	GPI10	P30777	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MRE11	P32829	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PXA2	P34230	853 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	OCT1	P35999	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ORC5	P50874	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	RSC1	P53236	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	FMP30	Q02883	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	APL4	Q12028	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ATG29	Q12092	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	HOM3	P10869	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	STE50	P25344	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SYN8	P31377	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MSS51	P32335	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SEC66	P33754	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PEX5	P35056	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	AFG3	P39925	761 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ALG5	P40350	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PET130	P47065	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	TWF1	P53250	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	NNF2	P53253	936 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SEC39	Q12745	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	GAL80	P04387	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	RAP1	P11938	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	CLB2	P24869	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	BLI1	P35727	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	CMC1	P36064	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	HOT13	P36078	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	NUP133	P36161	1157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	TSC10	P38342	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ARN1	P38731	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PFA5	Q03289	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	GRC3	Q07845	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	GPA1	P08539	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	CLB3	P24870	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	BOS1	P25385	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	IMG1	P25626	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	DBF4	P32325	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PDR8	Q06149	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	PIG1	Q06216	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MCH4	Q08268	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	RLM1	Q12224	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS31	YLR167W	MRP13	P12686	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ADK2	P26364	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	MIA40	P36046	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PXL1	P36166	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YJL068C	P40363	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	DOT5	P40553	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	MAF1	P41910	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YJL107C	P42947	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	TAX4	P47030	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	CLC1	P17891	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	YCR006C	P25350	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	GAC1	P28006	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	DBP8	P38719	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	PTR3	P43606	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	ASI1	P54074	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RMT2	Q03305	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	SWF1	Q04629	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	TPO3	Q06451	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	IRC3	Q06683	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	TEN1	Q07921	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS31	YLR167W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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