RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL047W	YLL047W	FMP42	Q04991	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	EDE1	P34216	1381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	SSH4	P32343	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	AGP2	P38090	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	YND1	P40009	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	BSC5	P53755	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	EKI1	Q03764	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	CDC23	P16522	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	RAD24	P32641	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	PDR3	P33200	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	ARP1	P38696	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	SAD1	P43589	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	PRE8	P23639	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	MGR1	P25573	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	GCS1	P35197	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	ATG27	P46989	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	DIA3	P52290	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	CUL3	P53202	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	SKM1	Q12469	655 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLL047W	YLL047W	HNM1	P19807	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	VMA16	P23968	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	PGS1	P25578	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	TSC10	P38342	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	UBA4	P38820	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YIR014W	P40570	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	NDD1	Q08887	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	PUT2	P07275	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	MIC60	P36112	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	SPC34	P36131	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	DBP8	P38719	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ELO1	P39540	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	FET5	P43561	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YKU80	Q04437	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	TCO89	Q08921	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ARP6	Q12509	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ARG81	P05085	880 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	PPZ1	P26570	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	BUR6	P40096	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YIL060W	P40519	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	SOL4	P53315	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	MEP3	P53390	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	NUP100	Q02629	959 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ENT4	Q07872	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	SNC1	P31109	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YJL070C	P40361	888 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	FAR3	P46671	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	PKP2	P53170	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YGR127W	P53275	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RTT109	Q07794	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	PHD1	P36093	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	ERG7	P38604	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RTS1	P38903	757 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	GUF1	P46943	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	EFM6	P53970	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YSA1	Q01976	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RAD30	Q04049	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	NRT1	Q08485	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	RDR1	Q08904	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	BSC1	Q12140	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	BAR1	P12630	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YTA12	P40341	825 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL047W	YLL047W	SEM1	O94742	89 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	CDC16	P09798	840 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	TYR1	P20049	452 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	CHS3	P29465	1165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	MCM10	P32354	571 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	YKL100C	P34248	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	LAG1	P38703	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL047W	YLL047W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23 ms