RNA–Protein interactions for RNA: YGR088W

CTT1, Transcript of Cytosolic catalase T, yeast

Gene CTT1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTT1	YGR088W	FRT2	P39734	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	SAD1	P43589	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	YGL176C	P46945	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	YJL007C	P47080	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	RSM26	P47141	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	CTR1	P49573	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	NCS6	P53088	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	NMA2	P53204	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	ARK1	P53974	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	MUK1	Q02866	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	SRL4	Q03085	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	RSM24	Q03976	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	ECM7	Q06200	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	BCP1	Q06338	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	ARO10	Q06408	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	SUE1	Q06524	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	YEH2	Q07950	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	HMS1	Q12398	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTT1	YGR088W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RAD10	P06838	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	WHI2	P12611	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ATR1	P13090	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HSP30	P25619	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RAD14	P28519	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PTP2	P29461	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DGR2	P32330	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TFC1	P32367	649 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	OCT1	P35999	772 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ETR1	P38071	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MRX3	P38172	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TDP1	P38319	544 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SLM1	P40485	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MAM33	P40513	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SNL1	P40548	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	UFE1	P41834	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	STB2	P46679	850 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PHO86	P46956	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SAM50	P53969	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	COX20	Q04935	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DFG5	Q05031	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ATG20	Q07528	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SKM1	Q12469	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	AVL9	Q12500	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ARP6	Q12509	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MET3	P08536	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CNA1	P23287	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CLB2	P24869	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PUP1	P25043	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IRE1	P32361	1115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ORC2	P32833	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ATO2	P32907	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CSG2	P35206	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	LRG1	P35688	1017 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YKL069W	P36088	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CTP1	P38152	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PCA1	P38360	1216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PZF1	P39933	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RGD2	P43556	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YJL045W	P47052	634 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MRM2	P53123	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YGL108C	P53139	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	REC102	Q02721	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GIM5	Q04493	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PRM6	Q04705	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	BSC2	Q05611	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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