RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W RPH1P39956 796 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W AXL1P40851 1208 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SPC105P53148 917 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W HED1Q03937 162 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YDR338CQ05497 695 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W IRC10Q08118 586 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YOL019WQ08157 551 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ICT1Q12385 394 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RAD3P06839 778 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W CDC4P07834 779 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W PMR1P13586 950 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W HSC82P15108 705 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W EXO70P19658 623 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W GAL11P19659 1081 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W NPP1P25353 742 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W HEM3P28789 327 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W BRF1P29056 596 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W PTM1P32857 523 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W SIP2P34164 415 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W THI80P35202 319 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W IME4P41833 600 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W TEL2P53038 688 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W ARP4P80428 489 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W SPO20Q04359 397 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W CRN1Q06440 651 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W MPD2Q99316 277 aa8.83□□□□□ -1
DDI1YER143W MSF1P08425 469 aa8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W PDB1P32473 366 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W OSW5P40219 148 aa8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W MRM2P53123 320 aa8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W IMP4P53941 290 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W GOT1Q03554 138 aa8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W HDA3Q06623 655 aa8.82□□□□□ -1
DDI1YER143W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W PUP3P25451 205 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W PMT1P33775 817 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W YBR259WP38338 688 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W COA1P40452 197 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W GAT1P43574 510 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W PEX13P80667 386 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W RMI1Q02685 241 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W TRM12Q04235 462 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W SPC24Q04477 213 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W RCO1Q04779 684 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W SEC10Q06245 871 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W OSW1Q08692 278 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W RAD59Q12223 238 aa8.81□□□□□ -1
DDI1YER143W FAB1P34756 2278 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W APA1P16550 321 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W SNT1P25357 1226 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W SPS19P32573 292 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W STB6P36085 766 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W STN1P38960 494 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data8.8□□□□□ -1not detected
DDI1YER143W PRM2P40534 656 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W UBP6P43593 499 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W LSB3P43603 459 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W TIS11P47977 285 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W RNR4P49723 345 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W MTO1P53070 669 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W SLM2P53955 656 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W UBP2Q01476 1272 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W YPL109CQ02981 657 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W GAS3Q03655 524 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W TAF12Q03761 539 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W PPN1Q04119 674 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W NSE1Q07913 336 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W ALR1Q08269 859 aa8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
DDI1YER143W PHO5P00635 467 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W SEC15P22224 910 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W SFP1P32432 683 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W SKT5P34226 696 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W ARP1P38696 384 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W DBP8P38719 431 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W EFM1P38732 585 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W LRP1P38801 184 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W SER33P40510 469 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W ATF2P53296 535 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W LSM3P57743 89 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W OSH6Q02201 448 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W CIA1Q05583 330 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W GLO2Q05584 274 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W BUD7Q08754 746 aa8.79□□□□□ -1
DDI1YER143W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W TIP20P33891 701 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W RIM11P38615 370 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W HSE1P38753 452 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W YHR045WP38775 560 aa8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms