RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W DSE3Q08729 430 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARP7Q12406 477 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ARP6Q12509 438 aa3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
VFA1YER128W SSM4P40318 1319 aa3.46□□□□□ -1.85
VFA1YER128W RAP1P11938 827 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W GCN3P14741 305 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W NAM9P27929 486 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MRS6P32864 603 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W VPS21P36017 210 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PXL1P36166 706 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CHK1P38147 527 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W COS111P38308 924 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TDA11P38854 504 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YRB2P40517 327 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W LYS14P40971 790 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W UFE1P41834 346 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ALY2P47029 1046 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YJR054WP47114 497 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YML6P51998 286 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MAL11P53048 616 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YGR111WP53265 400 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SPC98P53540 846 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W FOL1P53848 824 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W IRC4Q03036 179 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TRS130Q03660 1102 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PHO92Q06390 306 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W GRS2Q06817 618 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W THP3Q12049 470 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W AEP3Q12089 606 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ATG29Q12092 213 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MED1Q12321 566 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MPD2Q99316 277 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-FP0CX63 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-CP25384 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-BQ12491 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TY1B-DR3Q99231 1755 aa3.46□□□□□ -1.86
VFA1YER128W IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CIT1P00890 479 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SES1P07284 462 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MATALPHA2P0CY08 210 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HMLALPHA2P0CY09 210 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PHO8P11491 566 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SAT4P25333 603 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PER1P25625 357 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HMX1P32339 317 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W IMP2'P32351 346 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W VMA6P32366 345 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MYO3P36006 1272 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MRPL10P36520 322 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W APM3P38153 483 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YBR225WP38321 900 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SDH8P38345 138 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RCK2P38623 610 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CRP1P38845 465 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SER3P40054 469 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W GPD2P41911 440 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YFH7P43591 353 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W LIA1P47120 325 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YDL183CP48569 320 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YGL117WP53133 265 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YGR125WP53273 1036 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W OKP1P53298 406 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PGA2P53903 129 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 91.8 ms