RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MRE11	P32829	692 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RPC37	P36121	282 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.73	not detected
SYF1	YDR416W	NUP60	P39705	539 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	IME4	P41833	600 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	SMC3	P47037	1230 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	PET130	P47065	347 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.73	not detected
SYF1	YDR416W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	CDA1	Q06702	301 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	YDR416W	EDE1	P34216	1381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SPS22	P25380	463 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TAT1	P38085	619 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SLM4	P38247	162 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MMS4	P38257	691 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	FTR1	P40088	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	HXT14	P42833	540 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	IML1	P47170	1584 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YNL143C	P53908	130 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	INP2	Q03824	705 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SAM35	P14693	329 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	VPS3	P23643	1011 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YIH1	P25637	258 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	DOA4	P32571	926 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YME2	P32843	850 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	OSH7	P38755	437 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PZF1	P39933	429 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YNL195C	P40168	261 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YTA12	P40341	825 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PFA3	P42836	336 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	ELP2	P42935	788 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	INP52	P50942	1183 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SMA1	Q02651	245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	TRE1	Q08919	783 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	AIM41	Q12032	185 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	HIP1	P06775	603 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	NTH1	P32356	751 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RML2	P32611	393 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RRM3	P38766	723 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SDP1	P40479	209 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CTK2	P46962	323 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	VID30	P53076	958 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GIM3	P53900	129 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YNL050C	P53952	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	BOP3	P53958	396 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MCM21	Q06675	368 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MDM36	Q06820	579 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	GSH2	Q08220	491 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	HCS1	P34243	683 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MRPL4	P36517	319 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	EHT1	P38295	451 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YJL070C	P40361	888 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	CTR1	P49573	406 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	LYS5	P50113	272 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	COS12	P53053	380 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	HOP2	P53187	214 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YGR012W	P53206	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SEG1	Q04279	960 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	KIN82	P25341	720 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	URK1	P27515	501 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SRB5	P32585	307 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SFA1	P32771	386 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YHL012W	P38709	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SER3	P40054	469 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	FMS1	P50264	508 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	YNL144C	P53907	740 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	INA17	Q02888	182 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF1	YDR416W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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