RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	UBX6	P47049	396 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YEH1	Q07804	573 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SMC6	Q12749	1114 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YIH1	P25637	258 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MAL33	P38157	468 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	UBP13	P38187	747 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MET28	P40573	187 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YJL107C	P42947	387 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MSY1	P48527	492 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YNR061C	P53747	219 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	JJJ1	P53863	590 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	VTC3	Q02725	835 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	STP3	Q05937	343 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PSR1	Q07800	427 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SRL1	Q08673	210 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RIM20	Q12033	661 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	GRX6	Q12438	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	VMA16	P23968	213 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CLB3	P24870	427 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LAC1	P28496	418 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	APE4	P38821	490 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	FLO5	P38894	1075 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	UIP3	P39547	235 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MRX1	P40050	688 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YJL068C	P40363	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YIL152W	P40455	235 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ASG1	P40467	964 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MET18	P40469	1032 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CDC1	P40986	491 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	VID30	P53076	958 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	BOP3	P53958	396 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	AAT1	Q01802	451 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RMT2	Q03305	412 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YML037C	Q03703	340 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CRN1	Q06440	651 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PFA4	Q12006	378 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ATX2	Q12067	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YPT6	Q99260	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PMS1	P14242	873 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CLC1	P17891	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	REC107	P21651	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CNA1	P23287	553 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ADH7	P25377	361 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	POL4	P25615	582 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PTC6	P25646	442 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ATO2	P32907	282 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SRO77	P38163	1010 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CST26	P38226	397 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	VID24	P38263	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ARN1	P38731	627 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SMF1	P38925	575 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CCT6	P39079	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YEL057C	P39983	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	JEM1	P40358	645 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	NPA3	P47122	385 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ZDS2	P54786	942 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CIK1	Q01649	594 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ERO1	Q03103	563 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	NUP53	Q03790	475 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	FIN1	Q03898	291 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SWA2	Q06677	668 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YOR389W	Q08912	624 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ISA2	Q12425	185 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SPE4	Q12455	300 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	COX1	P00401	534 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YSP3	P25036	478 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	TOA1	P32773	286 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LHS1	P36016	881 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	VPS41	P38959	992 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PKP1	P40530	394 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SWP82	P43554	623 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	FAR3	P46671	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MDV1	P47025	714 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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