RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0297Q0297 BNA5Q05979 453 aa17.15■□□□□ 0.34
Q0297Q0297 ICT1Q12385 394 aa17.15■□□□□ 0.34
Q0297Q0297 ARG4P04076 463 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 SEC53P07283 254 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 RDS2P19541 446 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 EFM1P38732 585 aa17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 REV7P38927 245 aa17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 DUG1P43616 481 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 BOL2P53082 120 aa17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YLR177WQ06251 628 aa17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 UPC2Q12151 913 aa17.14■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 ATP11P32453 318 aa17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 BEM3P32873 1128 aa17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 UTP18P40362 594 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 SEC28P40509 296 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 GRS2Q06817 618 aa17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 ALR1Q08269 859 aa17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YMR030W-AQ3E760 96 aa17.13■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 ILV2P07342 687 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 THI80P35202 319 aa17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 PIM1P36775 1133 aa17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 GIM4P40005 111 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 ECM9Q02202 377 aa17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 UBX3Q12229 455 aa17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 KCS1Q12494 1050 aa17.12■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 RRP14P36080 434 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YHR020WP38708 688 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YHR182WP38870 785 aa17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YJL206CP39529 758 aa17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YAL037WP39728 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 HPT1Q04178 221 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YLR456WQ06199 204 aa17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 VHS3Q08438 674 aa17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 RGS2Q99188 309 aa17.11■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 TRX2P22803 104 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 ILV6P25605 309 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 LRG1P35688 1017 aa17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YPT52P36018 234 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 BIO4P53630 237 aa17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 ADE12P80210 433 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 EGD1Q02642 157 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 USA1Q03714 838 aa17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 STE23Q06010 1027 aa17.1■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 SWI5P08153 709 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 AMD2P22580 549 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 DEF1P35732 738 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 OCA5P38738 679 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YHR045WP38775 560 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 CEM1P39525 442 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 SSU1P41930 458 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 HST3P53687 447 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 YAT1P80235 687 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 PFA4Q12006 378 aa17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 CHS5Q12114 671 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Q0297Q0297 PHO5P00635 467 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 FUM1P08417 488 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 HSE1P38753 452 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data17.08■□□□□ 0.32not detected
Q0297Q0297 SAP1P39955 897 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 HXT16P47185 567 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 CLD1P53264 445 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 HXT15P54854 567 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 NHP10Q03435 203 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 YMR209CQ03648 457 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 TAF12Q03761 539 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 CSN9Q03981 162 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 TAF11Q04226 346 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 TRM12Q04235 462 aa17.08■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 YAR066WP0CX18 203 aa17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 YHR214WP0CX19 203 aa17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data17.07■□□□□ 0.32not detected
Q0297Q0297 RPB4P20433 221 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 PEP8P40335 379 aa17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 PFA3P42836 336 aa17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 GAT1P43574 510 aa17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 SLP1Q12232 587 aa17.07■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 CWP1P28319 239 aa17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 PTM1P32857 523 aa17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 SPF1P39986 1215 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 GOT1Q03554 138 aa17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 YLR053CQ12026 108 aa17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 GPR1Q12361 961 aa17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 NHA1Q99271 985 aa17.06■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 ASK1P35734 292 aa17.05■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 MUP3P38734 546 aa17.05■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 TFG1P41895 735 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 ROT1Q03691 256 aa17.05■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 UTP13Q05946 817 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 COX6P00427 148 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 CLB1P24868 471 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 MRPL37P36532 105 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 ARA1P38115 344 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 MEP1P40260 492 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 LSC1P53598 329 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 YDR056CQ12025 205 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 MDY2Q12285 212 aa17.04■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 CDC21P06785 304 aa17.03■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 PHA2P32452 334 aa17.03■□□□□ 0.32
Q0297Q0297 NTR2P36118 322 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms