RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-204ENST00000587718 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-204ENST00000587718 CPA4Q9UI42 421 aa29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKAB2O43741 272 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 BAG3O95817 575 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTLC2O15270 562 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CTGFP29279 349 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC27P30260 824 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMK4Q16566 473 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ANO1Q5XXA6 986 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FSIP1Q8NA03 581 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHA7Q9UN72 937 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 POTEFA5A3E0 1075 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP6R2O75170 966 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FOSBP53539 338 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF22Q14807 665 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT40Q6A162 431 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MICU3Q86XE3 530 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPFP49454 3210 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 OFD1O75665 1012 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GNRH1P01148 92 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCG2P16885 1265 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TERF1P54274 439 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 STX1AQ16623 288 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC39A14Q15043 492 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RTN1Q16799 776 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ANO6Q4KMQ2 910 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF333Q96JL9 665 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP2C8P10632 490 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 BCRP11274 1271 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CMA1P23946 247 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CKAP2LQ8IYA6 745 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CBX8Q9HC52 389 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK1Q14185 1865 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CAP2P40123 477 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TIGD1Q96MW7 591 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ANO10Q9NW15 660 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PI4KBQ9UBF8 816 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PHIPQ8WWQ0 1821 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-204ENST00000587718 DEXIO95424 95 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CALM1P0DP23 149 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CALM2P0DP24 149 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CALM3P0DP25 149 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC23AQ15436 765 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SBK1Q52WX2 424 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM47Q96LD4 638 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.261e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM75PA6NK02 468 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ORC4O43929 436 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF165P49910 485 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SENP2Q9HC62 589 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CLIC4Q9Y696 253 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FLT1P17948 1338 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF28PB7ZC32 967 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMC4P43686 418 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PRMT2P55345 433 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GADL1Q6ZQY3 521 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CERS3Q8IU89 383 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF11Q86T75 865 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.18■■■□□ 2.26
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