RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GPS1-225	ENST00000585084	KBTBD13	C9JR72	458 aa		33.82	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		33.82	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	TINF2	Q9BSI4	451 aa		33.82	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	BMP3	P12645	472 aa		33.81	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		33.81	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	DDX11	Q96FC9	970 aa		33.81	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	LNPK	Q9C0E8	428 aa		33.81	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	TSPY2	A6NKD2	308 aa		33.8	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	ATP2A1	O14983	1001 aa		33.8	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	FOXP2	O15409	715 aa		33.8	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	VPS53	Q5VIR6	699 aa		33.79	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	TICAM2	Q86XR7	235 aa		33.79	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		33.79	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	33.79	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	RIPK3	Q9Y572	518 aa		33.79	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		33.78	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		33.78	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	STX8	Q9UNK0	236 aa		33.78	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		33.77	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		33.77	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		33.77	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		33.77	■■■■□ 3
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM232	C9JQI7	657 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	FDX1	P10109	184 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	RARB	P10826	455 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	ALX1	Q15699	326 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	SMC5	Q8IY18	1101 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	FAM227B	Q96M60	508 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	INCENP	Q9NQS7	918 aa		33.76	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	SLC1A4	P43007	532 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	STAT2	P52630	851 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	OAZ1	P54368	228 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	GMCL1	Q96IK5	515 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	FBXO40	Q9UH90	709 aa		33.75	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084		A0A0D9SFI3	127 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC41	Q15345	812 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	FAM160B2	Q86V87	743 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	CHST13	Q8NET6	341 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	RILPL2	Q969X0	211 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	MCC	P23508	829 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	RTP1	P59025	263 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	TOMM22	Q9NS69	142 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		33.73	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	AKR1A1	P14550	325 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	ORC4	O43929	436 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	NMT2	O60551	498 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	FGA	P02671	866 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	TDH	Q8IZJ6	230 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		33.71	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	33.7	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	RNF180	Q86T96	592 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GPS1-225	ENST00000585084	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	FERMT2	Q96AC1	680 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	LRCH3	Q96II8	777 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	PLA2G6	O60733	806 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	IGHD	P01880	384 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	FGR	P09769	529 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	KCTD1	Q719H9	257 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	PGK1	P00558	417 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	NUCB1	Q02818	461 aa		33.67	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
GPS1-225	ENST00000585084	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		33.67	■■■□□ 2.98

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