RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	FEM1B	Q9UK73	627 aa		30.09	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	IGHA2	P01877	340 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	BMP3	P12645	472 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	GDF15	Q99988	308 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	TINF2	Q9BSI4	451 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	TOMM22	Q9NS69	142 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	STX8	Q9UNK0	236 aa		30.08	■■■□□ 2.41
PPP4C-208	ENST00000564966	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		30.07	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS53	Q5VIR6	699 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	RILPL2	Q969X0	211 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR7	Q9Y216	660 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		30.06	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM232	C9JQI7	657 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	INCENP	Q9NQS7	918 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	RIPK3	Q9Y572	518 aa		30.05	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	RARB	P10826	455 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	BMP8B	P34820	402 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	AAMP	Q13685	434 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM227B	Q96M60	508 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		30.04	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC1A4	P43007	532 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	FERMT2	Q96AC1	680 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		30.03	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	FOXP2	O15409	715 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	MCC	P23508	829 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	STAT2	P52630	851 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	RTP1	P59025	263 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0D9SFI3	127 aa		30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC41	Q15345	812 aa		30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	LRCH3	Q96II8	777 aa		30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	30.01	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP2A1	O14983	1001 aa		30	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	NMT2	O60551	498 aa		30	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO40	Q9UH90	709 aa		30	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	AKR1A1	P14550	325 aa		29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	KCTD1	Q719H9	257 aa		29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF180	Q86T96	592 aa		29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM160B2	Q86V87	743 aa		29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	TDH	Q8IZJ6	230 aa		29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	PGK1	P00558	417 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	CHST13	Q8NET6	341 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	GMCL1	Q96IK5	515 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	FDX1	P10109	184 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	OAZ1	P54368	228 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC96	Q2M329	555 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		29.97	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	FGA	P02671	866 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ALX1	Q15699	326 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC174	Q6PII3	467 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	SMC5	Q8IY18	1101 aa		29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	HAND2	P61296	217 aa		29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM60	Q495X7	471 aa		29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ACAD9	Q9H845	621 aa		29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		29.95	■■■□□ 2.39
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		29.95	■■■□□ 2.38
PPP4C-208	ENST00000564966	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		29.95	■■■□□ 2.38
PPP4C-208	ENST00000564966	ORC4	O43929	436 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PPP4C-208	ENST00000564966	IGHD	P01880	384 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PPP4C-208	ENST00000564966	SNAP25	P60880	206 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PPP4C-208	ENST00000564966	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PPP4C-208	ENST00000564966	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		29.94	■■■□□ 2.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms