RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 COBLO75128 1261 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 DAAM2Q86T65 1068 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 FLOT1O75955 427 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 GAS8O95995 478 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PRKAB2O43741 272 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 POLA2Q14181 598 aa23.3■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CMA1P23946 247 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PTGDRQ13258 359 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CFAP157Q5JU67 520 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 GPR108Q9NPR9 543 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SERPINB2P05120 415 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CYP21A2P08686 494 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 IFT20Q8IY31 132 aa23.29■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 GNA14O95837 355 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 XKR9Q5GH70 373 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 TRPC6Q9Y210 931 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 K7ENM7 598 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 GNPTABQ3T906 1256 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PTCH1Q13635 1447 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PSMC4P43686 418 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PEX26Q7Z412 305 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ERBB3P21860 1342 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CNKSR1Q969H4 720 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM7Q9C029 511 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KA1Q15418 735 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 M0QZ92 97 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 KCTD1Q719H9 257 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 NLRP10Q86W26 655 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 LCORLQ8N3X6 602 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ADD2P35612 726 aa23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 DESI2Q9BSY9 194 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 UBXN2AP68543 259 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R5DQ14738 602 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 ABCB4P21439 1286 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 PIGBQ92521 554 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.26■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 ATP10DQ9P241 1426 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 PTPROQ16827 1216 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 CDC25BP30305 580 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 FANCLQ9NW38 375 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 ATP5DP30049 168 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 SNX16P57768 344 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 CYP4A11Q02928 519 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 GALNT17Q6IS24 598 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 PGBD1Q96JS3 809 aa23.25■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 LIG4P49917 911 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 DCAF15Q66K64 600 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 GPR162Q16538 588 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 SETDB1Q15047 1291 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 GDF11O95390 407 aa23.24■■□□□ 1.31
SMURF1-201ENST00000361125 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.24■■□□□ 1.31
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