RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 PDE4BQ07343 736 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 PPARAQ07869 468 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR142Q7Z601 462 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 RILPL2Q969X0 211 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM227BQ96M60 508 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 GOPCQ9HD26 462 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 BTBD7Q9P203 1132 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 NYAP2Q9P242 653 aa20.48■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 PRDM1O75626 825 aa20.47■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.47■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A0D9SFI3 127 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 FLOT1O75955 427 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 GJA8P48165 433 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 ALX1Q15699 326 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 VPS53Q5VIR6 699 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 MB21D1Q8N884 522 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 USP6NLQ92738 828 aa20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PLGRKT-201ENST00000223864 HMGCRP04035 888 aa20.45■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 CYP2B6P20813 491 aa20.45■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MORN1Q5T089 497 aa20.45■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.45■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.45■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SDSP20132 328 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 RGS2P41220 211 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 DMRTA1Q5VZB9 504 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SHISA4Q96DD7 197 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP95Q96GE4 821 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.44■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 F5H6K3 240 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 RAD21O60216 631 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SGPL1O95470 568 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPY3P0CV98 308 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPY8P0CW00 308 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPREP23469 700 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 KLRC3Q07444 240 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR78Q5VTH9 848 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIB2Q92519 343 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MKL1Q969V6 931 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ATG4CQ96DT6 458 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.43■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 BRCA2P51587 3418 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 FGAP02671 866 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 CAPN2P17655 700 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TFAP4Q01664 338 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP2K5Q13163 448 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.42■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TTLL1O95922 423 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 DEFB118Q96PH6 123 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNK17Q96T54 332 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 APBA2Q99767 749 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 EPAS1Q99814 870 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ZMYM6O95789 1325 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 RPTORQ8N122 1335 aa20.41■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 HIP1O00291 1037 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 STRNO43815 780 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 NDUFB10O96000 172 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 FGRP09769 529 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM32Q13049 653 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 GRB14Q14449 540 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PLS1Q14651 629 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 LAMA4Q16363 1823 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 MROH8Q9H579 483 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.4■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.39■□□□□ 0.86
PLGRKT-201ENST00000223864 ORC4O43929 436 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms