RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Jakmip3Q5DTN8 844 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hook1Q8BIL5 728 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prl2c1Q5SVL9 228 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Usp49Q6P9L4 685 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spata21Q8BHW6 681 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Morc2bQ8C5W4 1022 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhb15Q91Y04 786 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Usp34Q6ZQ93 3582 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tph1P17532 447 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp13a3Q5XF89 1219 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Galnt17Q7TT15 598 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Epc2Q8C0I4 808 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rec8Q8C5S7 591 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim29Q8R2Q0 587 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gmcl1Q920G9 524 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SlkO54988 1233 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pls1Q3V0K9 630 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PRAG1Q571I4 1179 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ces1Q8VCC2 565 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AdpgkQ8VDL4 496 aa14.88□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kif3aP28741 701 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pfkfb1P70266 471 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cyp2e1Q05421 493 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ptger2Q62053 362 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tll1Q62381 1013 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gga3Q8BMI3 718 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MslnlQ8C160 685 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TicrrQ8BQ33 1889 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NynrinQ5DTZ0 1840 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zscan29E9Q5B4 869 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nap1l2P51860 460 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cnga2Q62398 664 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cnksr2Q80YA9 1032 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spon1Q8VCC9 807 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc5a5Q99PN0 618 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d2B1AVH7 922 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tex13cD3YU32 604 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10134F6ZQC6 126 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc39a2G3X943 309 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hoxa13Q62424 386 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ctdspl2Q8BG15 465 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PdcQ9QW08 244 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mmp10O55123 476 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pex1Q5BL07 1284 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krt23Q99PS0 422 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krtap5-3Q9D226 196 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dapk3O54784 448 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LdhbP16125 334 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdh15P33146 784 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DSCC1Q14AI0 399 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tnni3kQ5GIG6 834 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem130Q6NXM3 419 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep85Q8BMK0 761 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp202Q8C879 641 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Depdc1aQ8CIG0 804 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BccipQ9CWI3 316 aa14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arhgap4B1AUY3 965 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tshz1Q5DTH5 1084 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tas2r124Q7M718 309 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gprasp2Q8BUY8 826 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrrd1Q8C0R9 853 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plcg2Q8CIH5 1265 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BaatQ91X34 420 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kctd10Q922M3 315 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Flot1O08917 428 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snx13Q6PHS6 957 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IqcgQ80W32 419 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cul5Q9D5V5 780 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SisF8VQM5 1818 aa14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gcnt1Q09324 428 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bri3bpQ8BXV2 253 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cd274Q9EP73 290 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cry2Q9R194 592 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ArcQ9WV31 396 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Oog1E9Q5G7 496 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Usp17ldG5E8G2 545 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Usp17lcG5E8I7 545 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il4rP16382 810 aa14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clic6Q8BHB9 596 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.5 ms