RNA–Protein interactions for RNA: YOL137W

BSC6, Transcript of Protein of unknown function with 8 putative transmembrane segments, yeast

Gene BSC6, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BSC6	YOL137W	HAT2	P39984	401 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	ESL1	P40456	1118 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YDR109C	Q04585	715 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MUM3	Q08750	479 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	UBX3	Q12229	455 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	RMD5	Q12508	421 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	TPK2	P06245	380 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SNF4	P12904	322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.44	□□□□□ -0.26	not detected
BSC6	YOL137W	PHO87	P25360	923 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	DSS4	P32601	143 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PTH2	P34222	208 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MRK1	P50873	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	GPI1	P53306	609 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PET117	Q02771	107 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YDR131C	Q03899	556 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	TRP3	P00937	484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	HAP2	P06774	265 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MSS18	P08593	268 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	CNA1	P23287	553 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PHO91	P27514	894 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MET4	P32389	672 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YBR056W	P38081	501 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	TDP1	P38319	544 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MUP3	P38734	546 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	CYC2	P38909	366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	ECM10	P39987	644 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YJR154W	P47181	346 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	ARH1	P48360	493 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	GAS3	Q03655	524 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	GMC2	Q06201	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PGC1	Q08959	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SAM3	Q08986	587 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PSY3	Q12318	242 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	CCA1	P21269	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	NGG1	P32494	702 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PEX6	P33760	1030 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	TOM20	P35180	183 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	LHS1	P36016	881 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SPC42	P36094	363 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YBR284W	P38150	797 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	IST2	P38250	946 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SGT1	Q08446	395 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	CLN1	P20437	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PEP12	P32854	288 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SLX8	P40072	274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	BOL2	P53082	120 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	GTR2	P53290	341 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YNL033W	P53964	284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YNL019C	P53975	284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	NUP100	Q02629	959 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	LCB4	Q12246	624 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SAS5	Q99314	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	PTM1	P32857	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YEN1	P40028	759 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YIR007W	P40566	764 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	RTT101	P47050	842 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MRX6	P48564	524 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YLR413W	Q06689	675 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YDL121C	Q07541	149 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	NUS1	Q12063	375 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SEM1	O94742	89 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	MDJ1	P35191	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SFB3	P38810	929 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	VHR1	P40522	640 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	IMA5	P40884	581 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	DIA3	P52290	468 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	YGR053C	P53234	283 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SPP2	Q02521	185 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	RAD30	Q04049	632 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	BLS1	Q06071	122 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	LDB18	Q07887	179 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	VIK1	Q12045	647 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	ULA1	Q12059	462 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	SVS1	Q12254	260 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	NTO1	Q12311	748 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BSC6	YOL137W	HEM2	P05373	342 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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