RNA–Protein interactions for RNA: YOL073C

DSC2, Transcript of Multi-transmembrane subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene DSC2, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSC2	YOL073C	THI3	Q07471	609 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DSC2	YOL073C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DSC2	YOL073C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	MSH1	P25846	959 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SPL2	P38839	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	QRI7	P43122	407 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YNL144C	P53907	740 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YDR109C	Q04585	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	GAL1	P04385	528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	PIF1	P07271	859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	PET122	P10355	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	UIP5	P36137	443 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	IRC4	Q03036	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	RRI1	Q12468	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	GAL4	P04386	881 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	PTP2	P29461	750 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YOL057W	Q08225	711 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	TUS1	Q06412	1307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	HES1	P35843	434 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ARN1	P38731	627 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	UBP7	P40453	1071 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YJL107C	P42947	387 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	MDV1	P47025	714 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ZDS2	P54786	942 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	VTC3	Q02725	835 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	FCP1	Q03254	732 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
DSC2	YOL073C	SWI1	P09547	1314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	CNA1	P23287	553 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	URK1	P27515	501 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	NUP133	P36161	1157 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ZAP1	P47043	880 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YPT11	P48559	417 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	TAM41	P53230	385 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	GTB1	Q04924	702 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	PDR8	Q06149	701 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ATX2	Q12067	313 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SUL2	Q12325	893 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YPR117W	Q06116	2489 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ACA1	P39970	489 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YFH7	P43591	353 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YJR008W	P47085	338 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	YPR003C	P53394	754 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SNA4	Q07549	140 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSC2	YOL073C	ATP4	P05626	244 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	MSS18	P08593	268 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	RGT1	P32862	1170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	PXL1	P36166	706 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	BOP3	P53958	396 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	PHO81	P17442	1178 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	ATO2	P32907	282 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	SPC72	P39723	622 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	IMA1	P53051	589 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	UBX3	Q12229	455 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	TAO3	P40468	2376 aa		5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	MRP7	P12687	371 aa		5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	DJP1	P40564	432 aa		5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	STB2	P46679	850 aa		5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	VPS25	P47142	202 aa		5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	MCH4	Q08268	501 aa		5	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	CLB4	P24871	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	YCR006C	P25350	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	PRD1	P25375	712 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	YHR131C	P38835	850 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	ASG1	P40467	964 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSC2	YOL073C	NUP53	Q03790	475 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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