RNA–Protein interactions for RNA: YMR158W

MRPS8, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS8, Length 468 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS8	YMR158W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
MRPS8	YMR158W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	YNL234W	P53857	426 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	MAK10	Q02197	733 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	FMP42	Q04991	504 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	VID22	Q05934	901 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	ESL2	P36168	1195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	PSY4	P38193	441 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	UME6	P39001	836 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	SAD1	P43589	448 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	ARP10	Q04549	284 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	YLR302C	O13544	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	MGR1	P25573	417 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	PDR3	P33200	976 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	CNS1	P33313	385 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	STV1	P37296	890 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	RIC1	P40395	1056 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	VPS4	P52917	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	EKI1	Q03764	534 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	SSM4	P40318	1319 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	HNM1	P19807	563 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	CDC15	P27636	974 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	RKM3	P38222	552 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	SMA1	Q02651	245 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	ATG16	Q03818	150 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	YPK3	P38070	525 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	IME4	P41833	600 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	NNF2	P53253	936 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	ATG9	Q12142	997 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS8	YMR158W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RPB8	P20436	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PPZ1	P26570	692 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YIL060W	P40519	144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PKP1	P40530	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	MRP20	P32387	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	BZZ1	P38822	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	AXL2	P38928	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RTS2	P40962	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YGR021W	P53212	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PSR2	Q07949	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	NUS1	Q12063	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	BSC1	Q12140	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	CDC23	P16522	626 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RAD24	P32641	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	SLC1	P33333	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RTT107	P38850	1070 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	FMP10	P40098	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	IAH1	P41734	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	FET5	P43561	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RCO1	Q04779	684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RSF1	Q05043	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	BAR1	P12630	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	MIA40	P36046	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	FUI1	P38196	639 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	ARP1	P38696	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YER010C	P40011	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PKP2	P53170	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	SNO4	Q04902	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	HSP32	Q08992	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	TAH18	Q12181	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	GAC1	P28006	793 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	RGT1	P32862	1170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	ALY1	P36117	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	ATG27	P46989	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YGL260W	P53056	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	MUB1	Q03162	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	INP53	Q12271	1107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	GID7	P25569	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	PHO90	P39535	881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	SLZ1	P40167	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	SMC3	P47037	1230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	NUP100	Q02629	959 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS8	YMR158W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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