RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR047W	YKR047W	VID24	P38263	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ECM10	P39987	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YJL068C	P40363	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ASG1	P40467	964 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	OPT1	P40897	799 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	IRC8	P47046	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	DIA3	P52290	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	VID30	P53076	958 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	JJJ1	P53863	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ZDS2	P54786	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RMT2	Q03305	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	VPS38	Q05919	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CLB3	P24870	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SAS3	P34218	831 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CST26	P38226	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MUP3	P38734	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SDS3	P40505	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	GAL80	P04387	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	PMA2	P19657	947 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ADH7	P25377	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	PTC6	P25646	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	LTP1	P40347	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SSU1	P41930	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CYK3	Q07533	885 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	AVL9	Q12500	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ADK2	P26364	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SEF1	P34228	1148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	APE4	P38821	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	UIP3	P39547	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	TDA10	P42938	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YFR020W	P43600	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	PET130	P47065	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MAK10	Q02197	733 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	PUS9	Q12069	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ATG29	Q12092	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	INP53	Q12271	1107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	PMS1	P14242	873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	STB6	P36085	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	CHS7	P38843	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	PKP1	P40530	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	SGF73	P53165	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	GND2	P53319	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	GIS1	Q03833	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	ATG9	Q12142	997 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	SGS1	P35187	1447 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	PET111	P08468	800 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	REC107	P21651	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	GSH1	P32477	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	GCS1	P35197	352 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	ALG5	P40350	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	IPI3	P53877	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	BOP3	P53958	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	EFM6	P53970	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	AIM32	Q04689	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	ARO10	Q06408	635 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	RAD34	Q06665	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	RLM1	Q12224	676 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	MRP13	P12686	339 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	SPE2	P21182	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	AAD3	P25612	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YKR047W	YKR047W	PMT1	P33775	817 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.9 ms