RNA–Protein interactions for RNA: YJL138C

TIF2, Transcript of Translation initiation factor eIF4A, yeast

Gene TIF2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF2	YJL138C	SFB3	P38810	929 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CAJ1	P39101	391 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YER186C	P40101	306 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	BIT61	P47041	543 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YNL146W	P53906	100 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	SSY1	Q03770	852 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.68	□□□□□ -1.34	not detected
TIF2	YJL138C	PLP2	Q12017	286 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	RCN2	Q12044	265 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	BIK1	P11709	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CHS2	P14180	963 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CKA2	P19454	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	OCA4	P25366	362 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	RPC53	P25441	422 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	COG1	P53079	417 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YNR061C	P53747	219 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	VPS9	P54787	451 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YMR155W	Q03795	547 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	GAD1	Q04792	585 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CUR1	Q06469	252 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	VPS36	Q06696	566 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	NUS1	Q12063	375 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	UPC2	Q12151	913 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	GPR1	Q12361	961 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	POM34	Q12445	299 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ARG3	P05150	338 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	PET122	P10355	254 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	PEX1	P24004	1043 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	HEL1	P36113	551 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	SIC1	P38634	284 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	DJP1	P40564	432 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	POL31	P46957	487 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ZAP1	P47043	880 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CUL3	P53202	744 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	BTN2	P53286	410 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ADA2	Q02336	434 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	RCO1	Q04779	684 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	TPO1	Q07824	586 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	PSK2	Q08217	1101 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	THI72	Q08579	599 aa		6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CDC6	P09119	513 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ALG1	P16661	449 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YHL017W	P38745	532 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	FMO1	P38866	432 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YNL195C	P40168	261 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	YGR016W	P53209	190 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	PGA2	P53903	129 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	NRG1	Q03125	231 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	TRS31	Q03337	283 aa		6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
TIF2	YJL138C	GAL10	P04397	699 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	MET17	P06106	444 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	COY1	P34237	679 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	CTF13	P35203	478 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	MMS4	P38257	691 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	YHR112C	P38716	378 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	EPL1	P43572	832 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	SIP4	P46954	829 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	AVT1	P47082	602 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	RTC4	P53850	401 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	ADY4	Q05955	493 aa		6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	MTC7	P32633	139 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	YJL068C	P40363	299 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	MET12	P46151	657 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	SLG1	P54867	378 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	CIK1	Q01649	594 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	YSA1	Q01976	231 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	YLH47	Q06493	454 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	PEX19	Q07418	342 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	RTN2	Q12443	393 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	ECM3	Q99252	613 aa		6.63	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TIF2	YJL138C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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