RNA–Protein interactions for RNA: YHR153C

SPO16, Transcript of Meiosis-specific protein involved in synaptonemal complex assembly, yeast

Gene SPO16, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO16	YHR153C	INN1	P53901	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	YSA1	Q01976	231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	ENT4	Q07872	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	HUA2	Q12134	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	PET111	P08468	800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	GPA1	P08539	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	CNA1	P23287	553 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	YKL050C	P35736	922 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	RTS1	P38903	757 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	JHD1	P40034	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	YIL024C	P40543	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	NET1	P47035	1189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	PFA5	Q03289	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	RAD30	Q04049	632 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	YKU80	Q04437	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	PFA4	Q12006	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	INP53	Q12271	1107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	RRI1	Q12468	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPO16	YHR153C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SPE2	P21182	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	VMA16	P23968	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	STE50	P25344	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SPC97	P38863	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YFR020W	P43600	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YNL144C	P53907	740 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	STP1	Q00947	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ADH7	P25377	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	LYS14	P40971	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	APL4	Q12028	832 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	AAC3	P18238	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SAN1	P22470	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	CLB2	P24869	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	PXL1	P36166	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	DIA3	P52290	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	NNF2	P53253	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	CAC2	Q04199	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	BPT1	P14772	1559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	VPS41	P38959	992 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	FLC2	P39719	783 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	VPS25	P47142	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	NMD4	Q12129	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ATG9	Q12142	997 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	CHO1	P08456	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	MDM10	P18409	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	RPN12	P32496	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SCO2	P38072	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	MAL33	P38157	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	BUR6	P40096	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	PCI8	P40512	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YPT11	P48559	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	COG4	Q06096	861 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ATX2	Q12067	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YPR089W	O13585	888 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	GAL4	P04386	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YCK1	P23291	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YIH1	P25637	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	MIA40	P36046	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YGR127W	P53275	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ASI1	P54074	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	ZDS2	P54786	942 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	RCN2	Q12044	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	MED1	Q12321	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	SGS1	P35187	1447 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SPO16	YHR153C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SGF29	P25554	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	GAC1	P28006	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	FAR3	P46671	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	SGM1	P47166	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	ARP10	Q04549	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	MCP2	Q06567	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	POS5	Q06892	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	FRE3	Q08905	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	RTP1	Q12751	981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO16	YHR153C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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