RNA–Protein interactions for RNA: YHR147C

MRPL6, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL6, Length 645 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL6	YHR147C	TMT1	P32643	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	BUR6	P40096	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	VRG4	P40107	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	MDV1	P47025	714 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	NNF2	P53253	936 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	GSH2	Q08220	491 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	GEP3	Q08622	556 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	SPE2	P21182	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	FMP10	P40098	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	PKP1	P40530	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	SNM1	P40993	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	INN1	P53901	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	ASI1	P54074	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	INA17	Q02888	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	CAC2	Q04199	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YAP7	Q08182	245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	TCO89	Q08921	799 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YKL050C	P35736	922 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	RTS1	P38903	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	BOP3	P53958	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	MPS1	P54199	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	PSR1	Q07800	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	ENT4	Q07872	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	APL4	Q12028	832 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
MRPL6	YHR147C	UBX3	Q12229	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	ENT1	Q12518	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YBL029W	P38201	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	UIP3	P39547	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YEL068C	P39977	110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	LYS14	P40971	790 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	RAD30	Q04049	632 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	ARP10	Q04549	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	MCP2	Q06567	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	INP53	Q12271	1107 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	NKP1	Q12493	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	VMA16	P23968	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	AGP2	P38090	596 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	TMA108	P40462	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	ECI1	Q05871	280 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL6	YHR147C	CBP1	P07252	654 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	CDC16	P09798	840 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RPB8	P20436	146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	CLB2	P24869	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YTP1	P53584	459 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YNL234W	P53857	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	IZH1	Q03419	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	HUA2	Q12134	243 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	ATG9	Q12142	997 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	STV1	P37296	890 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	MAL33	P38157	468 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	SGF73	P53165	657 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YSA1	Q01976	231 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	DIA3	P52290	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	ZDS2	P54786	942 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	SNA4	Q07549	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	YCK1	P23291	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	ADH7	P25377	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	ATO2	P32907	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	MIA40	P36046	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	PAH1	P32567	862 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	LEU5	P38702	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	PCL6	P40038	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MRPL6	YHR147C	IRC8	P47046	822 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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