RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	ECI1	Q05871	280 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	VID22	Q05934	901 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	CLB2	P24869	491 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	PDR3	P33200	976 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	XRS2	P33301	854 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	CNS1	P33313	385 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	ESL2	P36168	1195 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	AXL2	P38928	823 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	YAT2	P40017	923 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	YIL060W	P40519	144 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	SAD1	P43589	448 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	EKI1	Q03764	534 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	ATG16	Q03818	150 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	FMP42	Q04991	504 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LRP1	YHR081W	HNM1	P19807	563 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PTH2	P34222	208 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	STV1	P37296	890 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PSY4	P38193	441 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	UME6	P39001	836 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	FMP10	P40098	244 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RIC1	P40395	1056 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	IME4	P41833	600 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	NNF2	P53253	936 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	BSC1	Q12140	328 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ATG9	Q12142	997 aa		3.21	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	SSM4	P40318	1319 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	MRP20	P32387	263 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	FUI1	P38196	639 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PKP2	P53170	491 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YNL181W	P53878	407 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ARP10	Q04549	284 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	SNO4	Q04902	237 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	GRS2	Q06817	618 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	HSP32	Q08992	237 aa		3.2	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	SLC1	P33333	303 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ALY1	P36117	915 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ARP1	P38696	384 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	FET5	P43561	622 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	VPS4	P52917	437 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YGR021W	P53212	290 aa		3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	BAR1	P12630	587 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RPB8	P20436	146 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PPZ1	P26570	692 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YPK3	P38070	525 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YER010C	P40011	234 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RTS2	P40962	232 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	CDC15	P27636	974 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RAD24	P32641	659 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ANS1	P38832	159 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PKP1	P40530	394 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YGL260W	P53056	76 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	INN1	P53901	409 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	NUP100	Q02629	959 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	NUS1	Q12063	375 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	CDC23	P16522	626 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	PGS1	P25578	521 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	RKM3	P38222	552 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	BZZ1	P38822	633 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	AZF1	P41696	914 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YML131W	Q03102	365 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	ENT4	Q07872	247 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	INP53	Q12271	1107 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LRP1	YHR081W	MIA40	P36046	403 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	BUR6	P40096	142 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SLZ1	P40167	298 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	IAH1	P41734	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	ATG27	P46989	271 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RTS3	P53289	263 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	MUB1	Q03162	620 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RCO1	Q04779	684 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.15	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.1 ms