RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RRN3	P36070	627 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MRPL4	P36517	319 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MET14	Q02196	202 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	FOB1	O13329	566 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	GAL1	P04385	528 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	PIF1	P07271	859 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RPB8	P20436	146 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SWI3	P32591	825 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	NFU1	P32860	256 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YJL068C	P40363	299 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	TMA108	P40462	946 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	TGL2	P54857	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MLC2	Q06580	163 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	PET122	P10355	254 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MIC60	P36112	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	STV1	P37296	890 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	GID7	P25569	745 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	PEX5	P35056	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SWH1	P35845	1188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SAP185	P40856	1058 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MEH1	Q02205	184 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SWA2	Q06677	668 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	OPY2	Q06810	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	EDE1	P34216	1381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	PHO81	P17442	1178 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SIR1	P21691	654 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	LHS1	P36016	881 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	UBP13	P38187	747 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RTS1	P38903	757 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MRX1	P40050	688 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	BOR1	P53838	576 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	GRC3	Q07845	632 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RAP1	P11938	827 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YSP3	P25036	478 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	LDB16	P25587	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	CHS3	P29465	1165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YBP1	P38315	674 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SLX1	P38324	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YEL068C	P39977	110 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	RGI2	P40188	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YGL242C	P53066	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	YML131W	Q03102	365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	SUL2	Q12325	893 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NEM1	YHR004C	CHO1	P08456	276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	PCA1	P38360	1216 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	HIS6	P40545	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	HXT9	P40885	567 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	FET5	P43561	622 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	TAM41	P53230	385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	RER1	P25560	188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	DBF20	P32328	564 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YKL050C	P35736	922 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YHL041W	P38730	149 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	NDE1	P40215	560 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	VTC2	P43585	828 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YPI1	P43587	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YJL132W	P47014	750 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	RCF1	Q03713	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	BSC6	Q08280	497 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	RIT1	P23796	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	IMP2'	P32351	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	PXA2	P34230	853 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	MUM2	P38236	366 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	RRT2	P38332	387 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	ERG7	P38604	731 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	ACA1	P39970	489 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SPG5	P42933	373 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	MAD3	P47074	515 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SWT1	Q12104	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	MED1	Q12321	566 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SSM4	P40318	1319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	BIK1	P11709	440 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	POL3	P15436	1097 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	CLB2	P24869	491 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	MCM10	P32354	571 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	SAS3	P34218	831 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NEM1	YHR004C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms