RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616641.4

PITX2-213, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PITX2, Length 3,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-213ENST00000616641 SGSM3Q96HU1 749 aa13.1□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.1□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 KAT14Q9H8E8 782 aa13.1□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.1□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.1□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 COL4A1P02462 1669 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 STK36Q9NRP7 1315 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 NFIXQ14938 502 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 TTC38Q5R3I4 469 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 F8W031 263 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 MAGEA9P43362 315 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 TROAPQ12815 778 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 GRIK5Q16478 980 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 SASH3O75995 380 aa13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 REXO1L1PQ8IX06 675 aa13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 IMPACTQ9P2X3 320 aa13.08□□□□□ -0.31
PITX2-213ENST00000616641 IKBKBO14920 756 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 LDHBP07195 334 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 BIRC2Q13490 618 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MYH15Q9Y2K3 1946 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 BPIFA3Q9BQP9 254 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.08□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 TSPY3P0CV98 308 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 TSPY8P0CW00 308 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 UIMC1Q96RL1 719 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 TEX33O43247 280 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 ACTN2P35609 894 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 RPAINQ86UA6 219 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 NYXQ9GZU5 481 aa13.07□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 EIF6P56537 245 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 NYAP1Q6ZVC0 841 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PNMA1Q8ND90 353 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MNS1Q8NEH6 495 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 BRIP1Q9BX63 1249 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 VPS18Q9P253 973 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 NARFQ9UHQ1 456 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 CTNND2Q9UQB3 1225 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PP2D1A8MPX8 630 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 SCG2P13521 617 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 SCP2P22307 547 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 INTS13Q9NVM9 706 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 GNG11P61952 73 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MTF1Q14872 753 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MCTP2Q6DN12 878 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 VSTM4Q8IW00 320 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PAGE5Q96GU1 130 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 VPS16Q9H269 839 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 LZTFL1Q9NQ48 299 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 DACH1Q9UI36 760 aa13.06□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 C6orf229H3BNL8 230 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 RIMBP2O15034 1052 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PHACTR2O75167 634 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 ATP2B2Q01814 1243 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 PICALMQ13492 652 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MLKLQ8NB16 471 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 EP400Q96L91 3159 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 C4AP0C0L4 1744 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 C4BP0C0L5 1744 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PITX2-213ENST00000616641 CNBD1Q8NA66 436 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms