RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH8P13535 1937 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 IGSF3O75054 1194 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-DOAP06340 250 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RXRAP19793 462 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS6KB1P23443 525 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNI2P48788 182 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TFAP4Q01664 338 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 GABPAQ06546 454 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF20Q5VTR2 975 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZUG5 572 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC6Q86TZ1 520 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL10Q9BUA6 226 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR7Q9Y216 660 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 PPFIA3O75145 1194 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 VSIG8P0DPA2 414 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 INPP5BP32019 993 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCY1A2P33402 732 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP16P51512 607 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 APOBRQ0VD83 1088 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 STK3Q13188 491 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DGKZQ13574 1117 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RABEP1Q15276 862 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 RUFY3Q7L099 469 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM83AQ86UY5 434 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CERS3Q8IU89 383 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SULF1Q8IWU6 871 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 NCOA7Q8NI08 942 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA5Q96FF9 252 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC14Q96N46 770 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 OTOFQ9HC10 1997 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY2A6NKD2 308 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ORC4O43929 436 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 GH2P01242 217 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FGRP09769 529 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY3P0CV98 308 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPY8P0CW00 308 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FECHP22830 423 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC15P60006 121 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2B2Q01814 1243 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE4BQ07343 736 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FUT2Q10981 343 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ST3GAL1Q11201 340 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFAIP1Q13829 316 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT2Q15019 361 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 NECAB1Q8N987 351 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPNS1-208ENST00000589162 BRF1Q92994 677 aa7.1□□□□□ -1.27
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