RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.79■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 PLS1Q14651 629 aa28.79■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 TMEM132BQ14DG7 1078 aa28.79■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.79■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.78■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 SEPT4O43236 478 aa28.78■■■□□ 2.2
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ACER3-211ENST00000531461 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
ACER3-211ENST00000531461 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.77■■■□□ 2.2
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ACER3-211ENST00000531461 MAML3Q96JK9 1138 aa28.77■■■□□ 2.2
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ACER3-211ENST00000531461 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa28.76■■■□□ 2.2
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ACER3-211ENST00000531461 NYAP2Q9P242 653 aa28.75■■■□□ 2.19
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ACER3-211ENST00000531461 GNAT2P19087 354 aa28.74■■■□□ 2.19
ACER3-211ENST00000531461 REPS2Q8NFH8 660 aa28.74■■■□□ 2.19
ACER3-211ENST00000531461 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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ACER3-211ENST00000531461 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.73■■■□□ 2.19
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ACER3-211ENST00000531461 MMP19Q99542 508 aa28.72■■■□□ 2.19
ACER3-211ENST00000531461 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.71■■■□□ 2.19
ACER3-211ENST00000531461 GPAA1O43292 621 aa28.71■■■□□ 2.19
ACER3-211ENST00000531461 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
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ACER3-211ENST00000531461 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.71■■■□□ 2.19
ACER3-211ENST00000531461 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.7■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 KBTBD13C9JR72 458 aa28.7■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 ZNF792Q3KQV3 632 aa28.7■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.7■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 LTBP2Q14767 1821 aa28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 RTP1P59025 263 aa28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 KCTD2Q14681 263 aa28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 SNX17Q15036 470 aa28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.69■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.69■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 F5H6K3 240 aa28.68■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 KLRC3Q07444 240 aa28.68■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 C1orf53Q5VUE5 145 aa28.68■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 TINF2Q9BSI4 451 aa28.68■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 RAD21O60216 631 aa28.67■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 LRRC41Q15345 812 aa28.67■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 TEX13BQ9BXU2 312 aa28.67■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.65■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
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ACER3-211ENST00000531461 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.65■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.65■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 DEFB123Q8N688 67 aa28.64■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.64■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.64■■■□□ 2.18
ACER3-211ENST00000531461 APPP05067 770 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 RARBP10826 455 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 CEP95Q96GE4 821 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.63■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 TTLL1O95922 423 aa28.62■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ACER3-211ENST00000531461 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.62■■■□□ 2.17
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