RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484657.5

GTPBP1-209, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 4

Gene GTPBP1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-209	ENST00000484657	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-209	ENST00000484657	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	FCER1A	P12319	257 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	COPB2	P35606	906 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657		Q7L0L9	218 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	CHGB	P05060	677 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRRC41	Q15345	812 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	VWA5A	O00534	786 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PLS1	Q14651	629 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	STAT3	P40763	770 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	MMP19	Q99542	508 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	DLL1	O00548	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	RASA1	P20936	1047 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	KCTD2	Q14681	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	RARB	P10826	455 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	APPBP2	Q92624	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP1-209	ENST00000484657	VCAN	P13611	3396 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	AKR1A1	P14550	325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	GNAT2	P19087	354 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	RNF180	Q86T96	592 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657		F5H6K3	240 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	NDUFB10	O96000	172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	PGK2	P07205	417 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	TLE2	Q04725	743 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	KLRC3	Q07444	240 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP1-209	ENST00000484657	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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