RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 STAP2Q9UGK3 403 aa21.44■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 GPAA1O43292 621 aa21.43■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 COBLO75128 1261 aa21.43■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 GNAT2P19087 354 aa21.43■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.43■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 DPP9Q86TI2 863 aa21.43■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 SLC25A27O95847 323 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 LTBP2Q14767 1821 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 REPS2Q8NFH8 660 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 NYAP2Q9P242 653 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.42■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 M0R2C6 588 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 PLS1Q14651 629 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 VWA5AO00534 786 aa21.4■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 ERC2O15083 957 aa21.4■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 MAML3Q96JK9 1138 aa21.4■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.39■■□□□ 1.02
SIKE1-205ENST00000466657 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 DNM1LO00429 736 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 FCER1AP12319 257 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 CNGA1P29973 690 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.39■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MCM3APO60318 1980 aa21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SEPT4O43236 478 aa21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SYN1P17600 705 aa21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MKL1Q969V6 931 aa21.38■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MX1P20591 662 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 COPB2P35606 906 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 STAT3P40763 770 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 TDO2P48775 406 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 F5H6K3 240 aa21.36■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 KLRC3Q07444 240 aa21.36■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.36■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.36■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 ATP2A1O14983 1001 aa21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 NDUFB10O96000 172 aa21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MMP19Q99542 508 aa21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.35■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 APPP05067 770 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 KCTD2Q14681 263 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 CEP95Q96GE4 821 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 FSD1Q9BTV5 496 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 COL6A3P12111 3177 aa21.34■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 FOXP2O15409 715 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 PRDM1O75626 825 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 GPR153Q6NV75 609 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 TDHQ8IZJ6 230 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 LRCH3Q96II8 777 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 TINF2Q9BSI4 451 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.33■■□□□ 1.01
SIKE1-205ENST00000466657 RAD21O60216 631 aa21.32■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 TTLL1O95922 423 aa21.32■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 PGK2P07205 417 aa21.32■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 SNX17Q15036 470 aa21.32■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 PDE4BQ07343 736 aa21.31■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 PPARAQ07869 468 aa21.31■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 NAPBQ9H115 298 aa21.31■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 RIPK3Q9Y572 518 aa21.31■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.3■■□□□ 1
SIKE1-205ENST00000466657 KBTBD13C9JR72 458 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms