RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNJ6P48051 423 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF165P49910 485 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RASGRF1Q13972 1273 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NTRK3Q16288 839 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZVU0 165 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FERMT3Q86UX7 667 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF214Q8ND24 703 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PNMA1Q8ND90 353 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BICD2Q8TD16 824 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARXQ96QS3 562 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP28Q96RU2 1077 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP7D2Q96T17 732 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NAPBQ9H115 298 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LY9Q9HBG7 655 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCHHQ07283 1943 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.21□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERICH2A1L162 156 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DYNC1I1O14576 645 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IKBKBO14920 756 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPTLC2O15270 562 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPS6KA4O75676 772 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHRNDQ07001 517 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SEMA3FQ13275 785 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IQCB1Q15051 598 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANO1Q5XXA6 986 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ESR2Q92731 530 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX11Q96FC9 970 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CBX8Q9HC52 389 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NARFQ9UHQ1 456 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HPSEQ9Y251 543 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYH7P12883 1935 aa6.21□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAMA4Q16363 1823 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DOCK2Q92608 1830 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC69A6NI79 296 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMTNL1A8MU46 457 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ORC4O43929 436 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CUTAO60888 179 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DEXIO95424 95 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHGBP05060 677 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 APPP05067 770 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XBP1P17861 261 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ME1P48163 572 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF75DP51815 510 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GSDMDP57764 484 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TPM4P67936 248 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITPK1Q13572 414 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM29Q14134 588 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STK38Q15208 465 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NR6A1Q15406 480 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SBK1Q52WX2 424 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.2□□□□□ -1.42
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms