RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	SLZ1	P40167	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	CHS6	P40955	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TAH11	P47112	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	CLA4	P48562	842 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LCL3	P53153	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TAM41	P53230	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TNA1	P53322	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TRS31	Q03337	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TMA16	Q08687	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	VPS54	Q12071	889 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SEC39	Q12745	709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YPT6	Q99260	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DRS2	P39524	1355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PRE8	P23639	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	NNK1	P36003	928 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	THI2	P38141	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	REG2	P38232	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	GIP2	P40036	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DOT5	P40553	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YBP2	P53169	641 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MAK10	Q02197	733 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PEX19	Q07418	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	UAF30	Q08747	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ELG1	Q12050	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	NUP170	P38181	1502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PET122	P10355	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	HMG2	P12684	1045 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SEF1	P34228	1148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TDP1	P38319	544 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	REV7	P38927	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YGR111W	P53265	400 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YGR130C	P53278	816 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SDH1	Q00711	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	OSW2	Q12202	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	UBX3	Q12229	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
TYW1	YPL207W	SYN8	P31377	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PEX32	P38292	413 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RRT2	P38332	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RFC3	P38629	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	VFA1	P40080	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	BUD7	Q08754	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DMC1	P25453	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	COS111	P38308	924 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ZAP1	P47043	880 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	NCS6	P53088	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PUS2	P53167	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YGR066C	P53242	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	VPS64	Q03944	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ATG29	Q12092	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MRP4	P32902	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ERC1	P38767	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PEX18	P38855	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LRO1	P40345	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YIL089W	P40500	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	BNI1	P41832	1953 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PXA1	P41909	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SSY5	P47002	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	VPS36	Q06696	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TCO89	Q08921	799 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PCL8	Q08966	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MMS4	P38257	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	INA22	P40576	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	EFM3	P47163	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MDR1	P53258	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RCM1	P53972	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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