RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A HOS2P53096 452 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YNL018CP53976 612 aa0.52□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ARG81P05085 880 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CLN1P20437 546 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PRE4P30657 266 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TEF4P36008 412 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YPK3P38070 525 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SDH8P38345 138 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SRP68P38687 599 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A LRO1P40345 661 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MNN11P46985 422 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MKC7P53379 596 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SNF12P53628 566 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SMM1P53720 384 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ECM11Q04110 302 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PHM6Q05637 104 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SUL2Q12325 893 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SWI6P09959 803 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PET122P10355 254 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SPO12P17123 173 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A HOP1P20050 605 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RVS161P25343 265 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CDC5P32562 705 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RMA1P36001 430 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ERG7P38604 731 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A IMD2P38697 523 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A NMD2P38798 1089 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YHR218WP38899 603 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A STL1P39932 569 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ALG8P40351 577 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A IMD3P50095 523 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SWT1Q12104 458 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A HAP1P0CE41 1502 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DAL2P25335 343 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A REG2P38232 338 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TIM17P39515 158 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ERV46P39727 415 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TIF4631P39935 952 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A IML2P47031 731 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DIA3P52290 468 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ESBP6P53918 673 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PEX15Q08215 383 aa0.51□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DYN1P36022 4092 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A VPS17P32913 551 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TGL1P34163 548 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A OCT1P35999 772 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A WSC4P38739 605 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A BEM4P39011 633 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YIL152WP40455 235 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YIR014WP40570 242 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YMR018WQ04364 514 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SWA2Q06677 668 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CDC45Q08032 650 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YPL191CQ08930 360 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A URA3P03962 267 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YAR066WP0CX18 203 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YHR214WP0CX19 203 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A AGA1P32323 725 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A REC114P32841 428 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A NOP2P40991 618 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ASK10P48361 1146 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MSS11Q03825 758 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RAD33Q04231 177 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YMR254CQ04838 102 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RSF1Q05043 376 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DCS2Q12123 353 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A GET3Q12154 354 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MDM12Q92328 271 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DOP1Q03921 1698 aa0.5□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A VAS1P07806 1104 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A NUC1P08466 329 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SGF29P25554 259 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A LDB16P25587 256 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A OAF3P36023 863 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ESF2P53743 316 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ADE16P54113 591 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YER145C-AA0A023PYF4 145 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RIT1P23796 513 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CWH43P25618 953 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PCL2P25693 308 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PRE2P30656 287 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A AGP2P38090 596 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SHO1P40073 367 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MDG1P53885 366 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RRN11Q04712 507 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YEH2Q07950 538 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A FRE3Q08905 711 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ATP2P00830 511 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data0.49□□□□□ -2.33not detected
YPL060C-AYPL060C-A MRC1P25588 1096 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RFA2P26754 273 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A FPR3P38911 411 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YEL057CP39983 233 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DFG10P40526 253 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A BST1P43571 1029 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SHY1P53266 389 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PSR1Q07800 427 aa0.49□□□□□ -2.33
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