RNA–Protein interactions for RNA: YOR242C

SSP2, Transcript of Sporulation specific protein that localizes to the spore wall, yeast

Gene SSP2, Length 1,116 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP2	YOR242C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	GSH2	Q08220	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	DSE3	Q08729	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	LHS1	P36016	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SWP82	P43554	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SCS3	P53012	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	BOP3	P53958	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	GTR1	Q00582	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	REG1	Q00816	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	FCP1	Q03254	732 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	UBX3	Q12229	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	CHO1	P08456	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	IES5	P40060	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YIL152W	P40455	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	BNA1	P47096	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	CTF18	P49956	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	IZH1	Q03419	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	ATG16	Q03818	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SWF1	Q04629	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	MRX1	P40050	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	MLH2	Q07980	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	TRM8	Q12009	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SSP2	YOR242C	SRB5	P32585	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	XRS2	P33301	854 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PSD1	P39006	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	CAC2	Q04199	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SSM4	P40318	1319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YCR043C	P25361	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	TFC3	P34111	1160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PSY4	P38193	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	UME6	P39001	836 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	ECM10	P39987	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	VRG4	P40107	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YFR020W	P43600	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	ASI1	P54074	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	RSM28	Q03430	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	POS5	Q06892	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	BUD7	Q08754	746 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	VCX1	Q99385	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	ERG8	P24521	451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	STE50	P25344	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	CNS1	P33313	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	CTK2	P46962	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	SRL1	Q08673	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YLR302C	O13544	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	RAP1	P11938	827 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	MNN2	P38069	597 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	FUI1	P38196	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	RTS3	P53289	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YTP1	P53584	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YNR061C	P53747	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	NUP53	Q03790	475 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	CBP1	P07252	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	RIC1	P40395	1056 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	MET30	P39014	640 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YIL169C	P40442	995 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	MEP2	P41948	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	SGF73	P53165	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YGR021W	P53212	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	ESBP6	P53918	673 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	ARP9	Q05123	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	SLC1	P33333	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	ESL2	P36168	1195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	PCL6	P40038	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	MCP2	Q06567	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	PSR2	Q07949	397 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SSP2	YOR242C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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