RNA–Protein interactions for RNA: YMR085W

YMR085W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR085W, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR085W	YMR085W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ADY2	P25613	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ITR2	P30606	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HXT4	P32467	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	XRS2	P33301	854 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CCL1	P37366	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YBL028C	P38202	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	UME6	P39001	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	GET2	P40056	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TMA108	P40462	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	IRC5	P43610	853 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ATG4	P53867	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SEC5	P89102	971 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YML131W	Q03102	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HLR1	Q04429	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TRI1	Q05024	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FAR8	Q05040	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	DON1	Q05610	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SYO1	Q07395	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MED4	Q12343	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MET5	P47169	1442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	NUC1	P08466	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CDC16	P09798	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PCK1	P10963	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CDC26	P14724	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CBP3	P21560	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SPO11	P23179	398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	AAD3	P25612	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CWH43	P25618	953 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	NPL6	P32832	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	JNM1	P36224	373 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	UBS1	P38290	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FZO1	P38297	855 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	EAF5	P39995	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	GID8	P40208	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SMK1	P41808	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MDV1	P47025	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	NUP84	P52891	726 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	IMO32	P53219	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ZDS2	P54786	942 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MFM1	Q02783	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ARA2	Q04212	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	DYN3	Q04949	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YPS7	Q06325	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ARO10	Q06408	635 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	GRC3	Q07845	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YPR089W	O13585	888 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	PHO5	P00635	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	REP1	P03871	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	TYR1	P20049	452 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	PEX1	P24004	1043 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	CHS3	P29465	1165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	EMP70	P32802	667 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	ATO2	P32907	282 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	FLO10	P36170	1169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	APE4	P38821	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	SPT8	P38915	602 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	YJL070C	P40361	888 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	CIR1	P42940	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	ILM1	P47155	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	SAP4	P53036	818 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	YGR016W	P53209	190 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	TAF11	Q04226	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	MLH3	Q12083	715 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	POM34	Q12445	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	REV3	P14284	1504 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	NUP159	P40477	1460 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	INH1	P01097	85 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	CTT1	P06115	562 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	PDE2	P06776	526 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMR085W	YMR085W	PGS1	P25578	521 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms